本发明涉及一种筛选高糖原含量长牡蛎亲贝的方法及其相关的SNP引物对。通过486个个体的全基因组关联分析,鉴定出位于长牡蛎6号染色体上的39个与糖原显著相关的SNP信号。针对该区域scaffold426_295,537碱基处的1个SNP位点,开发了相应的检测方法,同时所述该位点上下游500bp的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。同时该位点TT基因型个体相比较于CC基因型个体,糖原含量显著提高6.2%。筛选该位点的TT基因型亲贝,用于指导牡蛎育种。本发明有益效果在于可以在苗种繁育前对亲贝进行基因型鉴定,筛选该位点TT基因型亲贝,提高子代糖原含量。本研究结果是基于野生群体全基因组关联分析获得的SNP标记,效果更稳定。
本发明涉及一种鉴定长牡蛎高不饱和脂肪酸二十碳三烯酸(C20:3Ω6)含量个体的SNP标记开发及其应用方法。通过前期全基因组关联分析,鉴定出位于长牡蛎1号染色体上的38个与C20:3Ω6含量显著相关的成簇SNP信号。本发明针对该区域scaffold460_104,049碱基处的1个SNP位点,开发了其相应的检测方法,该位点存在A/T两种碱基形式,上下游500bp的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。通过该检测方法,筛选AT基因型的亲贝,指导牡蛎育种。本发明提供了在苗种繁育前对亲贝进行基因型鉴定,提高子代不饱和脂肪酸含量的方法,其结果是基于全基因组关联分析获得的SNP标记,效果更稳定。
本发明涉及一种用于筛选长牡蛎高糖原含量亲贝的方法及其相关SNP标记的引物对。该SNP位点在基因组DNA中存在A和G两个等位基因形式;其上下游500bp核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。实施结果表明利用该方法可以准确检测该SNP位点,筛选高糖原含量个体。同时该位点GG基因型个体相比较于AA基因型个体,糖原含量显著提高4.5%。后续可以通过该方法,筛选GG基因型的亲贝,指导牡蛎育种。本发明提供了一个筛选长牡蛎高糖原含量个体的SNP标记开发及其潜在应用,其有益效果在于可以在苗种繁育前对亲贝进行基因型鉴定,提高子代糖原含量。本研究结果获得SNP标记可信度更高,适应群体的范围更广,效果更稳定。