本发明提供一种用于血凝方法检测PCV2病毒的双功能纳米抗体、编码基因及其应用,属于生物技术领域。该双功能纳米抗体的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明还提供所述双功能纳米抗体的应用、编码基因、携带该编码基因的载体、重组菌。本发明还提供所述双功能纳米抗体的制备方法,将所述双功能纳米抗体的编码基因插入pMECS载体,然后导入大肠杆菌WK6感受态细胞,获得重组菌A;诱导重组菌A表达目的蛋白,裂解重组菌A后纯化获得所述双功能纳米抗体。采用本发明双功能纳米抗体检测PCV2病毒滴度的血凝方法,是国内外首次建立的基于鸡红细胞的PCV2病毒滴度血凝检测方法,灵敏度高、特异性好、耗时短,结果直观。