本发明属于基因工程技术领域，公开了一种Cas9蛋白、II型CRISPR/Cas9基因编辑系统及应用。本发明筛选了一种Cas9蛋白，其氨基酸序列如SEQ ID NO.1～3中任一种序列所示。本发明还提供了一种编码Cas9蛋白的核苷酸序列。本发明提供了一种II型CRISPR/Cas9基因编辑系统，包括上述的Cas9蛋白、辅助蛋白、CRISPR RNA和tracrRNA序列。采用本发明的II型CRISPR/Cas9基因编辑系统能够在crRNA的引导下，在原核细胞或真核细胞中行使基因编辑功能。本发明Cas9蛋白及基因编辑系统的发现扩大了基因编辑工具的种类，对推动基因编辑应用于临床治疗具有重要的作用。
本发明涉及一种Lt1Cas13d蛋白及基因编辑系统，其包含Lt1Cas13d蛋白或者编码所述Lt1Cas13d蛋白的一种或多种核苷酸序列，以及CRISPR RNA或转录所述CRISPR RNA的一种或多种核苷酸序列；其中，所述Lt1Cas13d蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示，或与SEQ ID NO.1具有至少80％的同源性的序列。本发明找到一种新的RNA核酸内切酶即Lt1Cas13d蛋白，并使用其开发了VI‑D型CRISPR/Cas13基因编辑系统，该基因编辑系统应用于编辑原核生物或真核生物基因，为基因编辑工具箱提供了新选择。
本发明涉及一种Cpf1蛋白及基因编辑系统，其包含Cpf1蛋白或者编码所述Cpf1蛋白的一种或多种多核苷酸，以及CRISPR RNA或一种或多种编码该CRISPR RNA的多核苷酸；其中，所述Cpf1蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示，或与SEQ ID NO.1具有至少80％的同源性的序列。本发明通过对宏基因组生物信息学分析，挖掘出一种新的2型CRSIPR/Cas基因编辑系统，该基因编辑系统应用于编辑原核生物或真核生物基因，为基因编辑工具箱提供了新选择。本发明提供一种新的V型CRISPR/Cas12a基因编辑系统，该基因编辑系统具有新理化性质且可以识别多种不同的PAM序列(TTNA)。
本发明涉及一种2型CRISPR/Cas9基因编辑系统，属于基因编辑技术领域。该基因编辑系统，包括Cas9蛋白、辅助蛋白、CRISPR RNA和反式激活CRISPR RNA；所述Cas9蛋白为DNA核酸内切酶，所述Cas9蛋白具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，或与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列至少80％相同的氨基酸序列。本发明通过生物信息学分析，挖掘出一种Faecalibaculumrodentium中的2型CRSIPR/Cas9基因编辑系统，该基因编辑系统应用于编辑原核生物或真核生物基因，为基因编辑工具箱提供了新的选择。
