本发明属于分子生物学和遗传学技术领域,具体涉及一种调控番茄外果皮表达的启动子及其应用,本发明启动子的核苷酸序列包括如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;或包含与SEQ ID NO:1所述核苷酸序列具有90%以上相似性的核苷酸序列;或包含来源于SEQ ID NO:1所述核苷酸序列上的100个及100以上连续的核苷酸片段。本发明首次发现番茄外果皮特异性启动子pSlPR10,可用于外源基因在番茄外果皮中的特异性表达,从而避免该外源基因在番茄的其他组织中持续表达所带来的不利影响,对番茄品种的改良具有重要意义,另外,在植物基因工程中利用本发明启动子能够使得外源目的基因在特定组织中高效表达,以便实现对外源基因表达进行定时、定点、定量的三维精确调控。