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[发明专利]检测水稻抽穗期基因OsELF3基因型的CAPS标记及应用-CN202310860268.1在审
发明人：张振华;梁燕;朱玉君;樊叶杨;黄得润;庄杰云 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2023-07-13 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供了一种检测水稻抽穗期基因OsELF3基因型的检测方法及其CAPS标记。该CAPS标记上游引物为ELF3caps‑F：5'‑CAAACAAAATAACTGGGGCGTTC‑3'；下游引物为ELF3caps‑R：5'‑CAAATGCCACTTGGATGTGAC‑3'。PCR产物经限制性内切酶Hpy188I酶切、琼脂糖凝胶电泳分离后，能够检测到长420bp单一条带的为OsELF3的OsELF3(L)型等位基因，可促进抽穗；能够检测到长348bp和72bp两条条带的为OsELF3的OsELF3(S)型等位基因，相对延迟抽穗。应用ELF3caps标记检测96份籼稻品种，结果显示该标记能够准确鉴定水稻OsELF3基因的OsELF3(L)和OsELF3(S)型等位基因。该方法准确性高、特应性强，在分子育种中具有较强的实用性。
检测水稻抽穗期基因 oself3 基因型 caps 标记应用

[发明专利]控制水稻粒型蛋白OsPUB3及其在水稻粒型改良中的应用-CN202210923901.2在审
发明人：朱玉君;张振华;王世林;庄杰云;樊叶杨;黄得润 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2022-08-02 - 公布日： 2023-04-11 - 主分类号： C12N9/10 文献下载
摘要：本发明提供了一个可用于水稻粒型改良的蛋白OsPUB3。应用CRISPR/Cas9基因编辑系统敲除水稻品种中恢161的OsPUB3基因，可有效改变中恢161的千粒重、粒长和粒宽，获得新的水稻种质。该结果表明本发明提供的水稻粒型蛋白OsPUB3可用于水稻粒型的改良。
控制水稻蛋白 ospub3 及其改良中的应用

[发明专利]筛选水稻粒重QTL qTGW10-21.9上高粒重等位基因的DNA标记及应用-CN202210498124.1在审
发明人：朱玉君;王世林;樊叶杨;张振华;黄得润;庄杰云 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2022-05-09 - 公布日： 2022-09-02 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明为筛选水稻粒重QTL qTGW10‑21.9上高粒重等位基因的DNA标记及应用，提供了一个用于筛选水稻千粒重QTL qTGW10‑21.9上高千粒重等位基因的DNA标记Ten21945及其在水稻千粒重改良育种中的应用。应用Ten21945能准确识别待鉴定水稻品种是否携带qTGW10‑21.9座位上IR24高千粒重等位基因。通过实例证明携带qTGW10‑21.9上IR24高千粒重等位基因的水稻材料千粒重显著增加，说明本发明设计的DNA标记Ten21945可有效应用于水稻千粒重的改良育种中。
筛选水稻粒重 qtl qtgw10 21.9 等位基因 dna 标记应用

[发明专利]水稻抗稻瘟病基因Pi25的功能特异性PCR分子标记及其应用-CN202210269994.1在审
发明人： 樊叶杨;朱玉君;张振华;黄得润;庄杰云 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2022-03-18 - 公布日： 2022-07-12 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供了水稻抗稻瘟病基因Pi25的功能特异性PCR分子标记及其应用，特征在于其引物。利用该标记对水稻苗期所提取的DNA进行PCR扩增和琼脂糖电泳，可以检测待测材料是否携带水稻抗稻瘟病等位基因Pi25，操作简单、安全经济、且准确性高、特异性强，可应用于水稻抗稻瘟病基因Pi25的分子标记辅助选择育种以及水稻种质资源筛选鉴定。
水稻稻瘟病基因 pi25 功能特异性 pcr 分子标记及其应用

[发明专利]鉴定水稻粒长QTL qGL5-27.3上长粒等位基因的特异性DNA标记及其应用-CN202110371434.2有效
发明人：朱玉君;牛小军;庄杰云;樊叶杨;张振华;黄得润 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2021-04-07 - 公布日： 2022-04-29 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供了一个用于鉴定水稻粒长QTL qGL5‑27.3上长粒等位基因的特异性DNA标记及其育种应用。借助该标记可以准确鉴定待测水稻材料在qGL5‑27.3上是否携带IRBB52长粒等位基因。通过实例证实携带qGL5‑27.3上IRBB52长粒等位基因的水稻株系粒长显著增加，表明本发明提供的DNA标记特异性好、准确性高，在粒长改良育种中具有应用前景。
鉴定水稻 qtl qgl5 27.3 上长粒等位基因特异性 dna 标记及其应用

[发明专利]检测水稻粒形QTLqGL35.1上细长粒等位基因的特异性PCR分子标记-CN201810068116.7有效
发明人：张振华;董青;樊叶杨;庄杰云;朱玉君 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2018-01-24 - 公布日： 2021-03-23 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供了检测水稻粒形QTL（quantitative trait loci,数量性状座位）qGL35.1上珍汕97细长粒等位基因的12个特异性PCR标记，分别为Wn35243、Wn35257、Wn35376、Wn35381、Wn35386、Wn35411、Wn35424、Wn35434、Wn35472、Wn35480、Wn35485和Wn35496，特征在于其PCR引物。利用这12个标记对水稻DNA进行鉴定，可以检测待测材料是否在目标座位上转入水稻品种珍汕97的细长粒等位基因，即是否具有减小粒宽、增加粒长、增加稻谷长宽比的能力，整个检测过程操作简单且准确性高。
检测水稻 qtlqgl35 细长等位基因特异性 pcr 分子标记

[发明专利]检测水稻粒重QTLqGW35.5上高粒重等位基因的特异性PCR分子标记-CN201810068095.9有效
发明人：张振华;王文慧;樊叶杨;庄杰云;朱玉君 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2018-01-24 - 公布日： 2021-03-23 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供了检测水稻粒重QTL（quantitative trait loci,数量性状座位）qGW35.5上密阳46高千粒重等位基因的7个特异性PCR标记，分别为Wn35550、Wn35554、Wn35604、Wn35608、Wn35626、Wn35632和Wn35635，特征在于其PCR引物。利用这7个标记对水稻DNA进行鉴定，可以分别检测待测材料是否在目标座位上转入水稻品种密阳46的高千粒重等位基因，即是否具有提高水稻粒重的能力，整个检测过程操作简单且准确性高。
检测水稻粒重 qtlqgw35 等位基因特异性 pcr 分子标记

[发明专利]检测水稻抽穗期基因Hd1基因型的特异性DNA标记及其应用-CN201910422536.5有效
发明人：张振华;庄杰云;樊叶杨;朱玉君 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2019-05-21 - 公布日： 2021-03-23 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供了检测水稻抽穗期基因Hd1基因型的特异性DNA标记及其应用。DNA标记共5个，包括InDel标记Si93368、Si93370、Si93379、Si93381和dCAPS标记Si93382。在这些标记上，能够依次检测到91bp、93bp、74bp、149bp和108bp条带者，为Hd1功能型等位基因。在这些标记上，能够检测到下述条带之一者，为Hd1非功能型等位基因：在Si93368上检测到90bp条带、在Si93370上检测到92bp条带、在Si93379上检测到73bp条带、在Si93381上检测到145bp条带、或在Si93382上检测到124bp条带。应用这5个DNA标记检测332份籼稻品种，结果显示这些标记能够准确鉴定水稻Hd1基因功能的有无。本发明设计的DNA标记准确性高、特应性强，在分子育种中具有较强的实用性。
检测水稻抽穗期基因 hd1 基因型特异性 dna 标记及其应用

[发明专利]一种弱感光籼稻恢复系的创制方法-CN202010721425.7在审
发明人： 樊叶杨;庄杰云;张振华;朱玉君 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2020-07-24 - 公布日： 2020-11-20 - 主分类号： A01H1/02 文献下载
摘要：本发明公开了一种弱感光籼稻恢复系的创制方法。具体地，首先选择水稻抽穗期基因Hd1均为功能缺失型、Ghd7均为功能型、Ghd8和Hd2各有1个为功能型的2个籼稻恢复系作为亲本；杂交后连续自交，利用单粒传法获得重组自交系群体；采用分期播种的方式，比较不同基因型组合的株系3期播种的抽穗期，获得携带功能缺失型Hd1以及功能型Ghd7、Ghd8和Hd2，即hd1Ghd7Ghd8Hd2基因型组合的弱感光籼稻恢复系。本发明结合常规育种和分子技术，针对特定基因筛选，提高了育种效率，而且为南方稻区广适性水稻品种的选育提供了理论基础和中间材料。
一种感光籼稻恢复创制方法

[发明专利]一种通过水稻微效基因克隆创建新等位变异的方法-CN202010678470.9在审
发明人：朱玉君;庄杰云;张振华;樊叶杨 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2020-07-15 - 公布日： 2020-10-23 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明公开了一种通过水稻微效基因克隆创建新等位变异的方法。具体地，从水稻品种珍汕97和密阳46衍生的次级群体中克隆微效粒长QTL qGL1‑34.3，粒长在珍汕97和密阳46等位基因间的差异约为0.021mm。采用CRISPR/Cas9基因编辑技术对qGL1‑34.3进行定向编辑，获得的新等位基因与野生型之间的粒长差异约为0.095mm，成功在微效基因座位上创建具有较大效应的等位变异。本发明为新等位变异创建提供新方法，有助于拓宽栽培稻的遗传变异，进而为水稻品种改良提供技术基础。
一种通过水稻基因克隆创建等位变异方法

[发明专利]检测水稻千粒重QTL qTGW10.2a上高千粒重等位基因的特异性分子标记-CN201810165410.X在审
发明人：朱玉君;庄杰云;樊叶杨;张振华 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2018-02-28 - 公布日： 2018-06-19 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供了检测水稻千粒重QTL(quantitative trait loci,数量性状座位)qTGW10.2a上特青高千粒重等位基因的10个特异性PCR标记，分别为Te20848、Te20864、Te20873、Te20882、Te20894、Te20905、Te20927、Te20939、Te20973和Te20993，特征在于其PCR引物序列。利用这10个标记对水稻DNA进行鉴定，可以检测待测水稻材料是否在qTGW10.2a区间转入水稻品种特青的高千粒重等位基因，即是否具有提高水稻千粒重的能力，整个检测过程操作简单且准确性高。
等位基因检测水稻特异性分子标记数量性状座位特异性PCR 过程操作水稻材料水稻品种水稻DNA 转入

[发明专利]检测水稻高粒重等位基因的特异性PCR分子标记-CN201510037836.3有效
发明人：朱玉君;王琳琳;庄杰云;樊叶杨 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2015-01-26 - 公布日： 2017-01-04 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供了检测水稻粒重QTL（quantitative trait loci,数量性状座位）qTGW1.2a和qTGW1.2b上密阳46高千粒重等位基因的8个特异性PCR标记，其中，7个用于检测qTGW1.2a，分别为Wn32837、Wn32886、Wn32893、Wn33185、Wn33186、Wn33304b和Wn33252，1个用于检测qTGW1.2b，为Wn34526，特征在于其PCR引物。利用这8个标记对水稻DNA进行鉴定，可以分别检测待测材料是否在2个目标座位上转入水稻品种密阳46的高千粒重等位基因，即是否具有提高水稻粒重的能力，整个检测过程操作简单且准确性高。
检测水稻粒重等位基因特异性 pcr 分子标记

[发明专利]检测控制水稻耐盐等位基因的特异性PCR分子标记-CN201310026317.8有效
发明人： 樊叶杨;朱玉君;庄杰云;董峰 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2013-01-23 - 公布日： 2013-05-15 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供了检测水稻品种Nona Bokra控制水稻耐盐等位基因SKC1的1个特异性PCR标记：Fir11466以及DST的3个特异性PCR标记：Th32637、Th32638和Th32639，特征在于其PCR引物。利用这4个标记对水稻苗期所提取的DNA进行鉴定，可以检测待测材料是否携带水稻品种Nona Bokra控制水稻耐盐等位基因SKC1以及DST。整个检测过程操作简单且准确性高。
检测控制水稻等位基因特异性 pcr 分子标记

[发明专利]检测水稻品种密阳46高硅含量等位基因qHUS6的特异性PCR分子标记-CN201210392832.3有效
发明人：应杰政;樊叶杨;庄洁云;朱玉君 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2012-10-16 - 公布日： 2013-01-09 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供了检测水稻品种密阳46高硅含量等位基因qHUS6的16个特异性PCR分子标记，分别为Si2925A、Si2925B、Si2926A、Si2926B、Si2927A、Si2927B、Si2927C1、Si2927C2、Si2927C3、Si2933A、Si2933B、Si2933C、Si2936、Si2939、Si2940、Si2946的PCR引物。利用这16个标记对水稻苗期所提取的DNA进行鉴定，可以检测待测材料是否转入水稻品种密阳46的高硅含量等位基因qHUS6，即是否具有提高水稻硅含量的能力，整个检测过程操作简单且准确性高。
检测水稻品种 46 含量等位基因 qhus6 特异性 pcr 分子标记

[发明专利]水稻产量基因GY6的克隆及其应用-CN201210047301.0有效
发明人： 樊叶杨;庄杰云;程式华;黄得润;朱玉君;付亚萍;刘文真 -专利权人：中国水稻研究所
申请日： 2012-02-28 - 公布日： 2012-08-22 - 主分类号： C12N15/29 文献下载
摘要：本发明属于植物基因工程领域，公开了分离克隆的控制水稻谷粒产量的基因GY6及其等位基因的核苷酸序列。所述序列如SEQ ID NO：1(珍汕97)和SEQ ID NO：4(密阳46)所示，包含4个外显子；其编码序列如SEQ ID NO：2和SEQ ID NO：5所示，其氨基酸序列如SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：6所示。两者在在编码区共存在11处单核苷酸多态，导致6个氨基酸变化。利用转基因技术获得了转GY6基因的水稻植株，转基因阳性植株表现出实粒数增加、千粒重提高、产量增加的特点。
水稻产量基因 gy6 克隆及其应用

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