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[发明专利]一种唾液乳杆菌在水产动物养殖中的应用-CN202310162290.9在审
发明人：张棋麟;朱欠华;应建平;付朝敏 -专利权人：昆明理工大学
申请日： 2023-02-24 - 公布日： 2023-07-11 - 主分类号： A23K10/18 文献下载
摘要：本发明公开了一株唾液乳杆菌(Lactobacillus salivarius)的新用途，即其水产动物养殖中的应用，该菌株应用在罗非鱼的养殖中，能促进罗非鱼生长，提高罗非鱼的肝脏抗氧化能力，提到其消化能力，维护罗非鱼的肠道健康，提高宿主对致病菌的抗病力，本发明菌种在包括罗非鱼等水产动物养殖中具有广阔的应用前景。
一种唾液杆菌水产动物养殖中的应用

[发明专利]一种蚰蜒诱捕装置-CN202111205516.6有效
发明人：张棋麟;赵梓舜;应建平;朱欠华;袁明龙;邓先余;郭军;章燕玫 -专利权人：昆明理工大学
申请日： 2021-10-15 - 公布日： 2022-12-13 - 主分类号： A01M1/02 文献下载
摘要：本发明提供一种蚰蜒诱捕装置。蚰蜒诱捕装置，包括：诱捕瓶；进物斗，所述进物斗设置在所述诱捕瓶的上方；下物管，所述下物管固定安装在所述进物斗的底端；锥形罩，所述锥形罩设置在所述进物斗的顶部；弧形隔板，所述弧形隔板固定安装在所述诱捕瓶的内壁上；支撑台，所述支撑台固定安装在所述诱捕瓶的底部内壁上；诱饵框，所述诱饵框设置在所述支撑台的顶部；进料框，所述进料框固定安装在所述诱捕瓶的外壁上；进料通槽，所述进料通槽开设在所述诱捕瓶的外壁上，且所述进料通槽与所述进料框相连通。本发明提供的蚰蜒诱捕装置具有使用方便、诱捕效果好的优点。
一种蚰蜒诱捕装置

[发明专利]一种串联序列解析方法、装置和存储介质-CN202110013886.3有效
发明人： 朱欠华;杨林峰;黎剑波 -专利权人：武汉华大基因技术服务有限公司
申请日： 2021-01-06 - 公布日： 2022-09-13 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本申请公开了一种串联序列解析方法、装置和存储介质。本申请的方法包括，从引物序列或其反向互补序列中截取锚片段P，在测序片段中与锚片段P完全匹配处截取与引物序列等长的片段S；将两者进行精确比对，保留比对长度占引物序列50％以上的结果，记录引物序列及其类型；根据引物序列的类型判断全长插入片段和连接点，根据连接点的引物类型，进行两端延伸，分析全长插入片段和非全长插入片段。本申请的方法，通过较短的锚片段P进行引物序列的快速定位，结合精确比对，提升了引物序列的比对效率；通过识别连接点，再根据连接点的引物类型，进行两端延伸，有效地避免了引物比对假阳性导致的拆分错误的问题，提升了拆分准确性和数据拆分率。
一种串联序列解析方法装置存储介质

[发明专利]一种核酸序列比对的方法-CN201810914779.6有效
发明人： 朱欠华;杨林峰 -专利权人：深圳华大基因科技服务有限公司
申请日： 2018-08-13 - 公布日： 2022-06-21 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种核酸序列比对的方法。该方法包括如下步骤：(1)获取与输入序列类似性积分最高的参考序列；(2)从所述参考序列中截取与输入序列等长的若干个比对序列；(3)将输入序列分别和比对序列比对，获取输入序列与各个比对序列的匹配信息；(4)根据步骤(3)获取的匹配信息，获取比对序列的比对得分；比对得分越高，则输入序列和该比对序列的相似度越高。本发明提供的核酸比对方法可以进行序列的比对，尤其是可以进行小序列的比对和一些存在突变(如插入突变、缺失突变)的小序列的比对。本发明具有重大的应用价值。
一种核酸序列方法

[发明专利]一种多组学数据联合分析的方法-CN201810111865.3有效
发明人： 朱欠华;高强;杨林峰;唐冲;刘赤川;何长寿 -专利权人：深圳华大基因科技服务有限公司
申请日： 2018-02-05 - 公布日： 2022-04-05 - 主分类号： G16B25/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种多组学数据联合分析的方法。本发明所提供的多组学数据联合分析的方法包括如下步骤：(A)对待分析的多组学数据中的每个单一组学的指标数据进行共表达网络分析，找到各自的表达模块；(B)根据不同组学数据各自的表达模块之间的重叠关系，筛选出所述待分析的多组学数据之间显著相关的互作模块。本发明所提供的多组学数据联合分析方法不受组学数据的数量限制，理论上可以是任意多个组；同时也不依赖输入数据的来源，只要是能衡量相应组学的指标数据(如基因表达量值、表观的甲基化程度，SNP突变率等)，都可以作为输入数据。
一种多组学数据联合分析方法

[发明专利]一种提取赤拟谷盗或雷氏黄萤线粒体的方法-CN202111088626.9在审
发明人：张棋麟;杨晓洁;袁明龙;郭军;应建平;赵梓舜;朱欠华;章燕玫 -专利权人：昆明理工大学
申请日： 2021-09-16 - 公布日： 2021-12-03 - 主分类号： C12N5/07 文献下载
摘要：本发明公开了一种提取赤拟谷盗及雷氏黄萤线粒体的方法，该方法是将赤拟谷盗成虫或雷氏黄萤幼虫组织匀浆后，采用差速离心和Nycodenz密度梯度离心的方法，获得纯化线粒体；本发明方法对线粒体的损伤小，提取的线粒体活性高，对线粒体以外的细胞核、内质网、细胞膜或胞浆蛋白组分等分离较为彻底；获得的线粒体具有高纯度、高活性等特性；这对后续的昆虫分子生物学实验的研究奠定了基础。
一种提取赤拟谷盗雷氏黄萤线粒体方法

[发明专利]一种新型的低起始量DNA甲基化建库方法-CN202010018080.9在审
发明人：唐冲;王娟;朱欠华;杨林峰;张弛;高强 -专利权人：深圳华大基因股份有限公司
申请日： 2020-01-08 - 公布日： 2021-07-09 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明公开了一种新型的低起始量DNA甲基化建库方法。本发明提供了一种制备甲基化测序文库的方法，依次包括如下步骤：(1)取基因组DNA，进行氧化脱氨处理；(2)进行全基因组扩增；(3)构建测序文库。步骤(1)中，采用酶化学法进行所述氧化脱氨处理，采用采用双加氧酶(TET2)进行氧化处理，采用胞嘧啶脱氨酶(APOBEC)进行脱氨处理。全基因组扩增的目的为将ng级别的DNA转换为μg级别的DNA。本发明提供的方法具有如下有益效果：可以做到极低起始量的基因组DNA甲基化处理，起始量可低至单细胞级别；操作步骤简单；对DNA的损伤最小；改善了现有微量甲基化建库的GC碱基分布不均衡，覆盖度低，duplication rate高等现象。
一种新型起始 dna 甲基化方法

[发明专利]一种快速预测目标miRNA的靶基因的方法-CN201810122291.X有效
发明人： 朱欠华;杨林峰;黎万顺;万胜青 -专利权人：深圳华大基因科技服务有限公司
申请日： 2018-02-07 - 公布日： 2021-06-22 - 主分类号： G16B25/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种快速预测目标miRNA的靶基因的方法。该方法，包括如下步骤：(1)k‑mer切分物种基因组的序列，得到k‑mer组合甲；k‑mer切分目标miRNA，得到k‑mer组合乙；(2)将k‑mer组合甲中的各个k‑mer及相应的靶基因信息进行存储，获得数据库；(3)将k‑mer组合乙中各个k‑mer的反向互补序列在所述数据库中检索，根据检索结果预测目标miRNA的靶基因。分别采用RNAhybrid软件、miRanda软件和本发明提供的方法预测21个目标miRNA的靶基因。结果表明，本发明提供的方法可以预测目标miRNA的靶基因且运行时间大大缩减。本发明具有重大的应用价值。
一种快速预测目标 mirna 基因方法

[发明专利]确定小核酸序列集合的方法及其应用-CN201911147900.8在审
发明人： 朱欠华;杨林峰 -专利权人：深圳华大基因科技服务有限公司
申请日： 2019-11-21 - 公布日： 2021-05-21 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明提出了一种确定小核酸序列集合的方法。该方法包括：(1)将由多个测序读段构成的测序结果划分为多个测序读段集合，所述测序结果是基于含有小RNA分子的核酸样本获得的；(2)针对所述多个测序读段集合的每一个，分别基于比对处理进行合并，以便获得多个合并测序读段集合；(3)基于比对处理，将所述多个合并测序读段集合进行合并，以便获得候选小核酸序列集合。
确定核酸序列集合方法及其应用

[发明专利]测序结果比对方法及其应用-CN201911148507.0在审
发明人： 朱欠华;杨林峰;万胜青 -专利权人：深圳华大基因科技服务有限公司
申请日： 2019-11-21 - 公布日： 2021-05-21 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明提出了一种测序结果比对方法。该方法包括：将参考序列按照第一预定长度进行k‑mer切分，构建索引库；基于每条测序读段的序列，确定种子序列集合，所述种子序列集合由多个种子序列构成，所述种子序列集合中所述种子序列的数目大于比对所允许的错配数，并且所述种子序列的长度不超过所述第一预定长度；将所述种子序列集合的至少一部分与所述索引库进行匹配；将测序读段与匹配上的参考序列进行全局比对。
结果方法及其应用

[发明专利]一种miRNA预测方法、miRNA系统及应用-CN201710601597.9在审
发明人： 朱欠华;黎万顺;万胜青 -专利权人：深圳华大基因科技服务有限公司
申请日： 2017-07-21 - 公布日： 2019-01-29 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本申请公开了一种miRNA预测方法、miRNA系统及应用。本申请的miRNA预测方法包括，(1)设定种子序列长度；(2)按照设定的长度对A、T、C、G四种碱基进行全排列，形成种子序列集；(3)去除种子序列集中冗余序列；(4)搜索种子序列在基因组上的位置，得到位置集；(5)将种子序列位置集，从小到大排列；(6)按位置集的位置遍历，如果前后两个位置序列互补，且距离不大于设定前体序列长度，输出该段序列；(7)采用二级结构预测软件对输出序列进行二级结构预测，获得miRNA，生成该物种的miRNA集。本申请的miRNA预测方法，直接在基因组序列中搜索miRNA，获得的miRNA集更完整，并且，效率高、更便捷，为后续miRNA研究奠定了基础。
种子序列位置集二级结构预测搜索申请基因组序列前体序列冗余序列输出序列位置序列基因组全排列遍历碱基去除应用物种输出研究

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