本发明涉及分子标记技术领域。本发明提供了一种与控制印度南瓜灰色果皮颜色基因Cmamg紧密连锁的分子标记及其应用，所述分子标记为Cmamg‑01，所述Cmamg‑01由DNA片段1和DNA片段2组成；所述DNA片段1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述DNA片段2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明的分子标记与控制印度南瓜果皮颜色基因紧密连锁，可以在植株苗期对其基因型进行直接选择，加快育种的进程，并为解析南瓜果皮颜色形成的调控机制提供新的基因资源和理论依据，有利于南瓜果皮颜色的精准育种。
本发明公开了一种与控制美洲南瓜浅白色果皮紧密连锁的分子标记、引物及应用。属于生物技术领域。为了快速、高效鉴定美洲南瓜浅白色果皮和加速绿果皮南瓜选育进程。本发明公开了分子标记组合物：(a)SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2；(b)SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4，还有分别扩增(a)组和(b)组分子标记的引物对：SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8。本发明提供的分子标记具有较高稳定性，可在南瓜幼苗期简便、快速地用于浅白色果皮类型的筛选，回交转育的方法可快速培养出美洲南瓜浅白色果皮品种改良品系。
