本发明公开了一种检测水稻光温敏雄性不育基因tms9‑1和pms3的KASP标记引物及其应用，包括检测tms9‑1基因的Ktms9‑1引物组和检测pms3基因的Kpms3引物组，所述Ktms9‑1引物组包括Ktms9‑1正向引物1、Ktms9‑1正向引物2、Ktms9‑1反向引物、淬灭探针1和淬灭探针2，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1‑3、8和10所示；所述Kpms3引物组包括Kpms3正向引物1、Kpms3正向引物2、Kpms3反向引物、淬灭探针1和淬灭探针2，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.4‑6、8和10所示。本发明改良和转育光温敏雄性不育系显得更为准确、快速和有效。
本发明公开了一种水稻雌性不育基因及其应用，所述水稻雌性不育基因的核苷酸序列为SEQ ID NO2所示的核苷酸序列；所述应用为所述水稻雌性不育基因在杂交水稻制种中的应用；本发明的FMS1基因对研究NB‑ARC基因家族的进化与功能具有特别重要的意义；并且本发明的FMS1基因用于杂交稻制种，可以降低种子生产成本和确保种子纯度，从而实现杂交水稻制种的机械化。
