本发明公开了一种水稻抗白叶枯病蛋白及其编码基因与应用。该水稻抗白叶枯病蛋白的名称为Xa7蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。编码该水稻抗白叶枯病蛋白的基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明通过构建水稻品种IRBB7的基因组BAC文库,文库筛选、候选插入片段测序、目标插入片段序列对AvrXa7识别位点预测、以及一系列的转基因功能互补试验、基因敲除试验,最终完成了Xa7功能基因的克隆。本发明首次提供了Xa7功能基因的序列,其可用于研究水稻抗白叶枯病的机制,用于培育对水稻白叶枯病具有抗病性的水稻品种或者其它抗病性作物,或是用于选育对水稻白叶枯病具有抗病性的水稻品种。
本发明公开了一种与水稻白叶枯抗病基因xa34(t)共分离的InDel分子标记及其检测引物与应用。该InDel分子标记包括如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。该InDel分子标记为共显性标记,能够区分纯合子和杂合子,适用于鉴别水稻白叶枯病抗性品种。该InDel分子标记特异性高;条带差异很大,用琼脂糖凝胶电泳即可清晰区分。本发明还提供了该InDel分子标记的检测引物,其由如SEQ ID NO.3所示的引物和如SEQ ID NO.4所示的引物组成。本发明还提供了该InDel分子标记的检测试剂盒,其包含前述检测引物。使用该检测引物或检测试剂盒,能大大加快水稻广谱抗白叶枯病分子育种的进程。