本发明公开了一种蛇孢假壳素类化合物母核合成基因AuOS及其应用,属于基因工程领域。该蛇孢假壳素类化合物母核合成基因AuOS来源于焦曲霉094102,其基因序列、cDNA序列和编码的AuOS蛋白的氨基酸序列分别如SEQ ID NO.1‑3所示。AuOS蛋白具有催化底物链长延伸和结构环化的功能,该蛋白能以DMAPP、GPP、FPP和GGPP这4种化合物为底物与IPP反应生成蛇孢假壳素类化合物母核。本发明首次发现了焦曲霉094102的AuOS基因,其编码蛋白具有催化底物链长延伸和结构环化的功能,能以DMAPP为底物从头合成蛇孢假壳素类化合物母核,可用于蛇孢假壳素类化合物的制备及其生物合成途径的研究。