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- [发明专利]一种多模态蛋白质构象空间搜索方法-CN201210593379.2有效
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张贵军;程正华;邓勇跃;周晓根;何阳军;姚春龙;张贝金
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浙江工业大学
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2012-12-31
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2013-05-01
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G06F17/30
- 本发明提出了一种多模态蛋白质构象空间搜索方法,即在排挤差分进化算法的基础上,综合了空间局部性原理和集结过程思想,并采用能量极小化过程对实验所得蛋白质构象进行处理。空间局部性原理提升了算法的收敛速度,并有效地平衡了多模态优化问题的局部收敛性和模态多样性;集结过程通过随机选取不同的交叉策略,避免了构象中较好片段被算法破坏,改善了蛋白质构象群体的多样性;能量极小化过程降低了蛋白质构象空间求解的复杂度,有效缩小了其可行域的搜索空间。本发明以脑啡肽为例,不仅得到了其公认的全局最稳定结构,还获得了一系列高质量的局部稳定结构,解决了传统针对单一靶点的单模态研究方法所不能解决的疾病多基因和多靶点通路的问题,满足了现阶段计算机辅助药物设计中对于蛋白质结构多模态的需求。
- 一种多模态蛋白质构象空间搜索方法
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