本发明公开了用于鉴定绿豆抗白粉病表型的分子标记SNP#2及其引物和应用。利用该分子标记SNP#2的引物对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.3在绿豆感白粉病品种中可扩增出大小为418bp的特征条带,在抗白粉病绿豆品种中不能扩增出特征条带;利用该分子标记SNP#2的引物对SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3在抗白粉病绿豆品种中可扩增出大小为418bp的特征条带,在绿豆感白粉病品种中不能扩增出特征条带。本发明通过定位绿豆抗白粉病位点,发现了与绿豆抗白粉病基因共分离的分子标记,该标记选择效率达100%。通过本发明分子标记引物鉴定或筛选绿豆白粉病抗性,方法快速简便,选择效率高且成本低廉。