本发明提供了一种检测油菜除草剂抗性ALS基因的KASP标记引物组、试剂盒及其应用，涉及生物技术领域。本发明设计KASP标记引物组包括用于检测BnALS1基因和BnALS3基因突变位点的特异性引物和通用引物，BnALS1和BnALS3基因共用一对特异性引物序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示，BnALS1基因的通用引物如SEQ ID NO.3所示，BnALS3基因的通用引物如SEQ ID NO.4所示。本发明设计的KASP引物组能特异性区分和检测BnALS1和BnALS3基因的突变位点G或T，检测株系的除草剂抗性。本发明设计的KASP检测方法准确可靠，操作方便，适用于BnALS1和BnALS3基因抗性位点的鉴定及辅助选择育种。
本发明涉及油菜育种及分子生物学领域，具体涉及一种与油菜粒重及角果长度紧密相关的分子标记及应用。一种与油菜粒重及角果长度紧密相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记对基因BnaA.ARF18a的分子标记，核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。该分子标记解决了常规育种方法中存在的粒重和角果长度只能后期鉴定，使得育种周期长、易受环境影响、选择效率低的问题，提高了油菜育种的效率，在油菜幼苗期就能能够快速可靠的鉴定不同品种油菜单株的粒重和角果长度，提高了油菜育种效率，大大的缩短了油菜育种年限。
本发明涉及一种油菜BnFAD2基因的新型的高油酸等位突变，并且涉及这类新型的高油酸等位变异SNP分子标记开发和分子标记辅助育种技术。本发明公开了甘蓝型油菜中BnFAD2基因的两对新型的高油酸等位突变（BnAfad2a和BnCfad2a）。所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1和ID NO：2所述。本发明还同时提供了可快速筛选这类新型高油酸等位突变位点的两对特异型的KASP分子标记KASP‑421和KASP‑1073，并利用该标记进行单株基因型鉴定和高油酸株系筛选。本发明提供的两对KASP分子标记均由油菜BnFAD2基因外显子区域SNP变异开发而来，筛选结果特异性更高，检测结果更为准确可靠。本发明提供的KASP分子标记只需PCR和荧光检测两个步骤，成本低、通量高，特别适用于育种群体后代高油酸基因型的分类筛选与鉴定。本发明两个分子标记的组合使用可以筛选得到油酸含量高达88%的后代材料。
