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[发明专利]一种诊断脑肿瘤和脑梗死的方法-CN202310793702.9在审
发明人：常珊;王志超;殷建;尹焕才;施璜浩;周利涛;许志旺;庞明威;邵赟;张颖;何王秋 -专利权人：江苏理工学院
申请日： 2023-06-30 - 公布日： 2023-10-03 - 主分类号： G01N21/65 文献下载
摘要：本发明公开了一种诊断脑肿瘤和脑梗死的方法，包括通过拉曼光谱仪采集脑肿瘤和脑梗死样本的拉曼光谱数据；使用基线校正、平滑处理和归一化方法对获取的拉曼光谱数据进行预处理；搭建卷积神经网络分类模型，对预处理后的拉曼光谱数据进行训练，调节模型参数得到收敛最佳模型；将待诊断样本的拉曼光谱数据输入所搭建的卷积神经网络模型中，输出待测目标的类别。本发明为医生对脑肿瘤和脑梗死的诊断提供了判断依据，进一步保障了患者的生命健康。
一种诊断肿瘤脑梗死方法

[发明专利]一种用于研究新型冠状病毒靶点蛋白的分子对接方法-CN202310676861.0在审
发明人：庞明威;何王秋;刘凯;朴莲花;孔韧;常珊 -专利权人：江苏理工学院
申请日： 2023-06-08 - 公布日： 2023-09-05 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于研究新型冠状病毒靶点蛋白的分子对接方法，确定对接任务的目标COVID‑19数据，选择上传该对接任务对应配体的数据文件，所述配体为小分子或者多肽或抗体蛋白；使用对接引擎将配体与目标COVID‑19数据进行对接，最后生成所上传配体与目标COVID‑19数据的若干种对接模式；根据设置的筛选规则，选择排名前十的对接模式，并将该十种对接模式在结果界面显示。本发明通过分子对接的方式进行模拟，针对高变异病毒，揭示病毒的分子进化规律提前预判病毒的变异和流行趋势，可以为疫苗和药物的升级、药物的研发提供理论指导和关键靶点，为疫情防控措施的提前布局提供信息支撑。
一种用于研究新型冠状病毒蛋白分子对接方法

[发明专利]一种用于研究雌雄受体调节剂的多构象对接系统-CN202310213654.1在审
发明人：孔韧;胡帅;常珊;许志旺;何王秋 -专利权人：江苏理工学院
申请日： 2023-03-08 - 公布日： 2023-05-23 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种用于研究雌雄受体调节剂的多构象对接系统，包括：小分子获取模块，用于接收预设格式的小分子化合物文件；小分子对接模块，与小分子获取模块连接，用于将小分子获取模块获得小分子化合物文件与第一数据库中的蛋白质结构进行对接，第一数据库中预先存储有雌激素受体和雄激素受体蛋白质结构；对接评价模块，与小分子对接模块连接，用于根据小分子对接模块生成的对接模型对接姿态的均方根偏差对对接结果进行评价。能够有效解决现有雌激素受体活性预测存在的复杂度高、操作困难、耗费大量人力物力等技术问题。
一种用于研究雌雄受体调节剂构象对接系统

[发明专利]一种蛋白分子机器的运动模式模拟方法-CN202211404471.X在审
发明人：孔韧;刘凯;常珊;何王秋;许志旺 -专利权人：江苏理工学院
申请日： 2022-11-10 - 公布日： 2023-01-31 - 主分类号： G16B5/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种蛋白分子机器的运动模式模拟方法，包括：S10获取蛋白分子机器结构数据文件；S20对蛋白分子机器的分子动力学进行模拟，得到复合物及其受体、配体运动的拓扑文件和坐标文件，并对其结合自由能进行计算；S30基于搭建的NRI模型及坐标文件对蛋白分子机器的运动轨迹进行预测，NRI模型中包括用于预测给定动态系统轨迹交互的编码器，及用于预测交互图中给定的动态系统轨迹的解码器；S40基于VR设备观察并记录蛋白分子机器的三维构造及运动轨迹。其结合分子动力学模拟和深度神经元网络，实现对蛋白分子机器的运动模式的精确模拟和预测。
一种蛋白分子机器运动模式模拟方法