本发明提供了一个与黄瓜白粉病抗性主效QTL共分离的SSR分子标记,命名为SSR‑N3。SSR‑N3的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明的SSR分子标记具有高稳定性,可以简便、快速地应用于黄瓜苗期白粉病抗性单株的辅助筛选,为白粉病抗性的分子标记辅助育种奠定了基础,这将大大加快黄瓜白粉病抗性分子育种的进程。同时,这个共分离的分子标记也为黄瓜白粉病抗性主效QTL的克隆奠定基础。
本发明提供了两个与控制黄瓜表皮毛/果刺起始基因Tril紧密连锁的分子标记。分别命名为FlankT‑01、FlankT‑02,FlankT‑01由SEQ ID NO.1所示的290个核苷酸的片段和SEQ ID NO.2所示的293个核苷酸的片段组成。其中,SEQ ID NO.1与有表皮毛/果刺基因Tril连锁,SEQ ID NO.2与无表皮毛/果刺基因tril连锁。FlankT‑02由序列表中SEQ ID NO.3所示的187个核苷酸片段和SEQ ID NO.4所示的197个核苷酸组成。其中,SEQ ID NO.3与有表皮毛/果刺基因Tril连锁,SEQ ID NO.4与无表皮毛/果刺基因tril连锁。本发明的两个分子标记分别在Tril基因的两侧,将Tril基因定位在37.4Kb区间,且都具有较高稳定性,可以简便、快速地应用于黄瓜有无表皮毛/果刺类型的分子标记辅助育种筛选体系。
本发明提供了一个与控制黄瓜果刺有无基因Tril共分离的显性分子标记,命名为CoT‑01,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述CoT‑01与有果刺基因Tril连锁,无果刺基因tril不能扩增出特异性片段。本发明的分子标记和Tril基因位点共分离,对黄瓜微毛和无毛品系的区分有很大帮助;且具有高稳定性,可以在黄瓜苗期便可简便、快速地区分有无果刺表型,可应用于相关的分子标记辅助育种中。
本发明涉及与黄瓜果实软刺基因Ts共分离的InDel‑Ts3分子标记及其应用。该分子标记由ME7所示的上游引物和EM8所示的下游引物组成。该分子标记具有序列表SEQ ID NO.1所示的244个核苷酸序列,以及序列表SEQ ID NO.2所示的234个核苷酸序列,其中SEQ ID NO.1中的核苷酸序列与软刺基因共分离,SEQ ID NO.2中的核苷酸序列与硬刺基因共分离。与现有技术相比,该分子标记具有高稳定性,可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜硬刺/软刺类型的筛选。
本发明涉及与黄瓜果实软刺基因Ts紧密连锁的InDel分子标记,分别命名为InDel‑Ts4和InDel‑Ts5,分子标记InDel‑Ts4具有序列表SEQ ID NO.1所示的229个核苷酸序列;分子标记InDel‑Ts5具有序列表SEQ ID NO.2所示的177个核苷酸序列。分子标记InDel‑Ts4由ME9所示的上游引物和EM10所示所示的下游引物组成;分子标记InDel‑Ts5由ME11所示的上游引物和EM12所示的下游引物组成。此两个分子标记的特征是与软刺基因紧密连锁,以便分子标记辅助育种体系的建立。该分子标记具有高稳定性,可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜硬刺/软刺类型的筛选。
本发明提供了三个与黄瓜白粉病抗性主效QTL共分离的SSR分子标记,分别命名为SSR‑N1、SSR‑N2和SSR‑N3。SSR‑N1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;SSR‑N2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;SSR‑N3的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。本发明的三个SSR分子标记都具有高稳定性,可以简便、快速地应用于黄瓜苗期白粉病抗性单株的辅助筛选,为白粉病抗性的分子标记辅助育种奠定了基础,这将大大加快黄瓜白粉病抗性分子育种的进程。同时,这些共分离的分子标记也为黄瓜白粉病抗性主效QTL的克隆奠定基础。
本发明提供了一个与黄瓜白粉病抗性主效基因共分离的InDel分子标记,命名为InDel‑MLO1,由SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段组成;其中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段与抗病基因共分离,SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段与感病基因共分离。本发明的InDel分子标记具有高稳定性,可以简便、快速、高通量的应用于黄瓜苗期白粉病抗性单株的辅助筛选;根据SEQ ID NO.5与SEQ ID No.6所示,由插入/缺失突变造成的抗性候选基因DNA长度的差异,还可以设计多对共显性的InDel标记作为白粉病抗性筛选的分子标记。本发明的InDel标记为白粉病抗性的分子标记辅助育种奠定了基础,这将大大加快黄瓜白粉病抗性分子育种的进程。