本发明公开了与高粱地上部分干重相关基因SbDW1的SNP分子标记及应用。本发明涉及分子生物技术领域,具体涉及单倍型分子标记在鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重中应用。包括检测待测高粱基因组中SNP的多态性或基因型或高粱单倍型,根据所述基因型鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重,所述SNP1为序列表中SEQ ID No.1的第603位核苷酸,其为T或G;所述SNP2为序列表中SEQ ID No.1的第814位核苷酸,其为T或A。可将检测所述SNP多态性和基因型或高粱单倍型的物质与其他物质(如检测其他与高粱地上部分干重相关的分子标记的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备鉴定高粱地上部分干重的产品。
本发明公开了检测玉米基因组中SNP的多态性的物质在鉴定玉米镉含量中的应用。该SNP位点的名称为ZmCd10‑KASP‑158410625,位于序列表SEQ ID NO.1的第333位,其核苷酸种类为T或C。本发明所要保护的一个技术方案是检测玉米基因组中ZmCd10‑KASP‑158410625的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定玉米镉含量产品中的应用。在188份玉米自交系品种中,96.24%的SNP基因型TT的玉米品种籽粒镉含量均低于0.1mg/kg,85.45%的SNP基因型CC的玉米品种籽粒镉含量均高于0.1mg/kg,该SNP可用于玉米育种及低镉玉米品种的选育。
本发明公开了培育低镉积累水稻的方法及其相关材料的用途。该培育低镉积累水稻的方法,包括抑制或降低目的水稻中OsCd1/2基因表达,得到低镉积累水稻,目的水稻为含有OsCd1/2基因的水稻,所述低镉积累水稻对镉的积累量小于目的水稻对镉的积累量;OsCd1/2基因编码名称为OsCd1/2的蛋白质,OsCd1/2为a)或b):a)氨基酸序列是SEQ ID No.2或SEQ ID No.4的蛋白质;b)将SEQ ID No.2或SEQ ID No.4的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的具有调控生物镉积累活性的由a)衍生的蛋白质。本发明可得到低镉积累水稻,降低食品风险。
本发明公开了水稻籽粒镉含量相关基因LCd‑22的SNP分子标记的应用。该应用具体可为TagSNP‑266272在鉴定或辅助鉴定水稻籽粒镉含量中的应用;所述TagSNP‑266272是水稻基因组的一个SNP位点,TagSNP‑266272是位于水稻第6号染色体上SEQ ID No.1的第69位核苷酸,其为C或T。实验证明,94%的基因型TT的水稻品种中籽粒镉含量均低于0.2mg/kg,94%的基因型CC的水稻品种的水稻籽粒镉含量均高于0.2mg/kg,说明本发明的TagSNP‑266272是水稻籽粒镉含量相关的SNP分子标记。
本发明公开了水稻籽粒镉含量相关基因LCd‑41的SNP分子标记的应用。该应用具体可为TagSNP‑20844875在鉴定或辅助鉴定水稻籽粒镉含量中的应用;所述TagSNP‑20844875是水稻基因组的一个SNP位点,TagSNP‑20844875是位于水稻第10号染色体上SEQ ID No.1的第308位核苷酸,其为A或T。实验证明,89%的基因型AA的水稻品种中籽粒镉含量均低于0.2mg/kg,93%的基因型TT的水稻品种的水稻籽粒镉含量均高于0.2mg/kg,说明本发明的TagSNP‑20844875是水稻籽粒镉含量相关的SNP分子标记。