[发明专利]一种诊断和预测口腔鳞状细胞癌的系统

说明书

本发明通过CNA评分系统，可以实现仅需很小的活检组织，就可以实现癌变风险或者口腔鳞状细胞癌的诊断和预测，且准确度极高。本发明提供了口腔鳞状细胞癌诊断和预测的客观指标，避免了在病理分级上由于不同医生，而存在的主观差异。

技术领域

本发明涉及医药领域，具体涉及一种诊断和预测口腔鳞状细胞癌的系统。

背景技术

口腔黏膜潜在恶性病变(oralpotentialmalignantdisorders，OPMDs)是发生于口腔黏膜，具有一定恶变潜质的病变或状态的总称，它类型各异、种类繁多且病程长，多为慢性疾病，包括口腔扁平苔藓(orallichenplanus，OLP)、尼古丁口炎(nicotinestomatitis)、口腔白斑(oralleukoplakia，OLK)、口腔红斑(oralerythroplakia，OEK)以及口腔黏膜下纤维性变(oralsubmucousfibrosis，OSF)等病变。

口腔癌在我国的发病率在3.6/10万-8.0/10万人之间，90％为口腔鳞状细胞癌(oralsquamous cellcarcinoma，OSCC)，占全身恶性肿瘤发病率的3％，位居全身恶性肿瘤第六位。虽然目前OSCC已经开展了以手术治疗为主，联合放疗、化疗等多学科综合序列治疗策略，但是患者5年生存率仍维持在60％左右，晚期OSCC患者的5年生存率仅为15％。研究发现，相当一部分OSCC来源于OPMDs，OLK的癌变率约在0.13％-17.5％范围内，OLP癌变率大约在1.18％-2.09％范围内，OSF的癌变率大约在1.7％-7.6％范围内，而OEK患者绝大多数发生癌变。虽然OPMDs癌变过程的确切机制尚未明确，但是对于OPMDs患者的早期诊断、早期治疗、监测以及对其恶变风险的评估都有助于减少口腔癌的发生。

口腔鳞状细胞癌是口腔颌面部最常见的恶性肿瘤，起源于口腔黏膜上皮细胞。晚期OSCC患者预后较差，早期诊断和治疗可以改善OSCC的预后。但由于OSCC的异质性，目前尚无有效的生物标志物用于早期诊断。

OSCC通常由口腔黏膜潜在恶性病变(oralpotentiallymalignantdisorders,OPMD)发展而来。目前，OPMD的癌变预测主要基于对HE染色切片的观察确定的组织病理学分级，但组织病理学分级存在主观性，不同医生的诊断存在差异。而且活检属于有创检查，有些患者身体存在其他疾病而无法耐受活检手术；切取活检时微小的病变和较深层次的病变很容易漏检，若没有一次取到癌变组织，还有可能进行二次活检，且结果与病理医师阅片有很大的关系。有创的检测技术不适合作为OPMDs早期诊断及长期监测、回访的手段，积极探索OPMDs及癌变早期的无创检查、诊断具有重大意义。

发明内容

拷贝数变异(copynumberalteration,CNA)是指在基因组中与参考序列相比，由删除、复制、插入、倒位、易位的DNA片段组合而产生的染色体结构变异。CNA所代表的基因组改变特征可以反映癌症的演变，CNA的发生早于恶性组织病理学形态的出现。利用CNA预测OPMD的癌变风险可以降低和延缓OSCC的发生，实现早期诊断和治疗，提高患者生存。

OPMD病变的诊断通常来源于病理医生对小块活检组织的HE染色进行判断。小块OPMD组织在福尔马林固定石蜡包埋后大部分RNA被破坏，因此，难以进行分子分析。

本发明利用激光捕获显微解剖可以对福尔马林固定石蜡包埋样本和新鲜样本精准取材到数百个细胞。然后，对这些少量细胞进行低深度全基因组测序，检测样本的CNA。该技术准确地从组织病理切片中分离出少量细胞，保留了空间位置和病理形态，提高了分析的精准度。

本发明提供了一种诊断和预测口腔鳞状细胞癌的系统，其特征在于包括：组织切片染色系统、激光捕获显微切割系统、细胞裂解系统、低深度全基因组测序系统和CNA评分计算系统；

其中组织切片染色系统将组织切片按苏木素浸染、分化、返蓝、伊红浸染的顺序进行苏木素和伊红(HE)染色；