[发明专利]一种病理切片的3D重建方法、装置、设备及介质

说明书

本发明提供一种病理切片的3D重建方法、装置、设备及介质，包括获取病理切片序列的切片影像；对所述切片影像进行预处理；获取预设生理组织特征；基于所述预设生理组织特征对预处理后各相邻切片影像进行配准得到配准关系；基于所述配准关系对所述病理切片序列进行3D重建得到3D影像。通过识别跨切片的生理结构，提高病理切片序列的配准精度和效率，为进一步研究微观生理组织的3D结构特征提供基础数据。

技术领域

本发明涉及医学影像技术领域，特别是涉及一种病理切片的3D重建方法、装置、设备及介质。

背景技术

相比于医学放射影像的医学数字成像和通信数据DICOM(Digital Imaging andCommunications in Medicine)，已经是可直接使用的3D体素形式，目前新兴的高清数字病理影像，由于病理切片是对生理组织的物理切片拍摄所得，原始数据仍然以二维影像为主，且很少有连续拍摄的多切片序列，因此需要对二维影像进行3D重建，3D重建结果可被用于进一步的病灶分析、医学3D打印等数字医学的精准治疗。而传统技术在对病理切片序列进行3D重建的过程中，通常将切片外轮廓作为配准目标，由于不同切片层外轮廓不一致，导致无法精准高效配置或者说对齐相邻切片的位置关系，从而无法得到准确的3D影像。

因此，有必要提供一种病理切片的3D重建方法、装置、设备及介质，以有效解决上述问题。

发明内容

本发明提供一种病理切片的3D重建方法、装置、设备及介质。

本发明实施例提供一种病理切片的3D重建方法，包括：获取病理切片序列的切片影像；对所述切片影像进行预处理；获取预设生理组织特征；基于所述预设生理组织特征对预处理后各相邻切片影像进行配准得到配准关系；基于所述配准关系对所述病理切片序列进行3D重建得到3D影像。

优选地，所述对所述切片影像进行预处理，包括：调整各所述切片影像的顺序；调整各所述切片影像的方位。

优选地，所述获取预设生理组织特征，包括：获取切片精度最高的所述切片影像，并提取其中的细胞核；计算每个所述细胞核的中心点坐标，并形成生理组织轮廓，以得到所述预设生理组织特征。

优选地，所述预设生理组织特征包括脂肪间隙特征或细胞核形成的生理结构特征。

优选地，所述基于所述预设生理组织特征对预处理后各相邻切片影像进行配准得到配准关系，包括：获取每个切片影像中细胞核的中心点坐标；基于各所述切片影像中所述细胞核的中心点的坐标及所述预设生理组织特征，得到每个所述切片影像对应的二值影像及所述切片影像变换为所述二值影像的变换矩阵B；按照切片序列的顺序对各相邻所述二值影像进行配准，得到每一层二值影像与第一层二值影像的配准变换矩阵R；基于所述变换矩阵B和所述配准变换矩阵R，得到各所述切片影像与切片序列的第一张切片影像的配准变换关系。

优选地，所述基于所述配准关系对所述病理切片序列进行3D重建得到3D影像，包括：以所述第一张切片影像为参照影像，并基于所述配准变换关系进行重采样得到配准后的二维切片彩色影像；将各所述二维切片彩色影像按顺序拼接，得到病理切片重建结果；基于切片特征和所述病理切片重建结果得到所述3D影像。

优选地，还包括：基于所述3D影像识别并分割出感兴趣生理结构。

与现有技术相比，本发明实施例的技术方案具有以下有益效果：