[发明专利]一种病理切片的3D重建方法、装置、设备及介质在审
| 申请号: | 202310179336.8 | 申请日: | 2023-02-27 |
| 公开(公告)号: | CN116246019A | 公开(公告)日: | 2023-06-09 |
| 发明(设计)人: | 金剑;李容嘉;祝杰 | 申请(专利权)人: | 上海迪派生物科技有限公司 |
| 主分类号: | G06T17/00 | 分类号: | G06T17/00;G06T7/33 |
| 代理公司: | 上海谱璟专利代理事务所(普通合伙) 31422 | 代理人: | 顾雯 |
| 地址: | 200444 上海市宝*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 病理 切片 重建 方法 装置 设备 介质 | ||
1.一种病理切片的3D重建方法,其特征在于,包括:
获取病理切片序列的切片影像;
对所述切片影像进行预处理;
获取预设生理组织特征;
基于所述预设生理组织特征对预处理后各相邻切片影像进行配准得到配准关系;
基于所述配准关系对所述病理切片序列进行3D重建得到3D影像。
2.根据权利要求1所述的病理切片的3D重建方法,其特征在于,所述对所述切片影像进行预处理,包括:
调整各所述切片影像的顺序;
调整各所述切片影像的方位。
3.根据权利要求1所述的病理切片的3D重建方法,其特征在于,所述获取预设生理组织特征,包括:
获取切片精度最高的所述切片影像,并提取其中的细胞核;
计算每个所述细胞核的中心点坐标,并形成生理组织轮廓,以得到所述预设生理组织特征。
4.根据权利要求1所述的病理切片的3D重建方法,其特征在于,所述预设生理组织特征包括脂肪间隙特征或细胞核形成的生理结构特征。
5.根据权利要求3所述的病理切片的3D重建方法,其特征在于,所述基于所述预设生理组织特征对预处理后各相邻切片影像进行配准得到配准关系,包括:
获取每个切片影像中细胞核的中心点坐标;
基于各所述切片影像中所述细胞核的中心点的坐标及所述预设生理组织特征,得到每个所述切片影像对应的二值影像及所述切片影像变换为所述二值影像的变换矩阵B;
按照切片序列的顺序对各相邻所述二值影像进行配准,得到每一层二值影像与第一层二值影像的配准变换矩阵R;
基于所述变换矩阵B和所述配准变换矩阵R,得到各所述切片影像与切片序列的第一张切片影像的配准变换关系。
6.根据权利要求5所述的病理切片的3D重建方法,其特征在于,所述基于所述配准关系对所述病理切片序列进行3D重建得到3D影像,包括:
以所述第一张切片影像为参照影像,并基于所述配准变换关系进行重采样得到配准后的二维切片彩色影像;
将各所述二维切片彩色影像按顺序拼接,得到病理切片重建结果;
基于切片特征和所述病理切片重建结果得到所述3D影像。
7.根据权利要求1所述的病理切片的3D重建方法,其特征在于,还包括:
基于所述3D影像识别并分割出感兴趣生理结构。
8.一种病理切片的3D重建装置,其特征在于,包括:
预处理模块,用于获取病理切片序列的切片影像,并对所述切片影像进行预处理;
结构化模块,用于获取预设生理组织特征,并基于所述预设生理组织特征对预处理后各相邻切片影像进行配准得到配准关系;
3D重建模块,用于基于所述配准关系对所述病理切片序列进行3D重建得到3D影像。
9.一种计算机设备,包括存储器和处理器,所述存储器存储有计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现权利要求1至7中任一项所述的方法的步骤。
10.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1至7中任一项所述的方法的步骤。
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