[发明专利]基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法

权利要求书

1.基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)以T₄和OH-PBDEs作为配体分子，转甲状腺素蛋白TTR作为受体蛋白；

(2)通过Autodock软件将所述配体分子与受体蛋白进行分子对接，输出构象信息与计算结果，并分析得到OH-PBDEs对甲状腺激素分泌的干扰作用与分子结构之间的关系；

(3)利用步骤(2)的分析结果，预测OH-PBDEs对甲状腺激素分泌的干扰作用。

2.根据权利要求1所述的基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法，其特征在于，步骤(1)中，所述OH-PBDEs配体小分子包括3'-OH-BDE-7、4'-OH-BDE-17、3'-OH-BDE-28、2-OH-BDE-28、4-OH-BDE-42、3-OH-BDE-47、4'-OH-BDE-49、6-OH-BDE-47、2'-OH-BDE-68、3-OH-BDE-100、6-OH-BDE-82、4-OH-BDE-90、4'-OH-BDE-101、5'-OH-BDE-99、6'-OH-BDE-99、6-OH-BDE-137、3'-OH-BDE-154、6-OH-BDE-157、4-OH-BDE-188、6-OH-BDE-180、6-OH-BDE-182、4'-OH-BDE-201、1'-OH-BDE-201、2'-OH-BDE-201、3'-OH-BDE-201中的至少一种。

3.根据权利要求1所述的基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法，其特征在于，步骤(1)中，所述T₄和OH-PBDEs配体分子利用Avogadro构建，TTR转甲状腺素受体蛋白在PDB蛋白库下载。

4.根据权利要求3所述的基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法，其特征在于，步骤(1)中，所述TTR转甲状腺素受体蛋白还经过预处理步骤，所述预处理步骤包括剔除TTR转甲状腺素受体蛋白中的水分子。

5.根据权利要求1所述的基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法，其特征在于，步骤(2)中，Autodock软件包括AutoGrid程序与AutoDock程序；运用Autodock软件的对接流程如下：将配体小分子与受体蛋白文件导入AutoGrid程序中，设置搜索区域，生成受体位点网格，输出格点能量的计算结果，在AutoDock程序中以拉马克遗传算法作为对接算法进行分子对接，输出构象信息与计算结果。

6.根据权利要求5所述的基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法，其特征在于，所述搜索区域包含TTR受体蛋白结构中所有的活性结合位点。

7.根据权利要求6所述的基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法，其特征在于，所述搜索区域的具体参数为：三维各方向格点的数量x＝126，y＝126，z＝126，格点间隔为0.375，中心坐标为(0，0，0)。

8.根据权利要求1所述的基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法，其特征在于，步骤(2)中，使用VMD对输出的结果进行分析。

9.基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测系统，其特征在于，所述系统采用如权利要求1-8任一所述基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法进行OH-PBDEs对甲状腺激素分泌的干扰预测分析。

10.一种存储介质，为计算机可读存储介质中的一种，其特征在于，其上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时，实现如权利要求1-8任一所述基于分子对接的OH-PBDEs的甲状腺干扰预测方法。