[发明专利]一种前列腺癌MAPK14抑制剂及其筛选方法和应用在审
申请号: | 202310039950.4 | 申请日: | 2023-01-13 |
公开(公告)号: | CN116189811A | 公开(公告)日: | 2023-05-30 |
发明(设计)人: | 戴早;魏官云 | 申请(专利权)人: | 南通大学 |
主分类号: | G16C20/70 | 分类号: | G16C20/70;G16C10/00;G16B40/00 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 强萌 |
地址: | 226019 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 前列腺癌 mapk14 抑制剂 及其 筛选 方法 应用 | ||
1.一种前列腺癌MAPK14抑制剂,其特征在于,所述抑制剂为Shinflavanone。
2.权利要求1所述的一种前列腺癌MAPK14抑制剂的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1)根据TCMSP数据库的数据和UniProt数据库,设置筛选条件,根据OB和DL筛选,获取复方中药的潜在靶标并进行注释;
所述复方中药的成分为黄芪、熟地黄、黄精、莪术、姜黄、猪茯苓和甘草;
步骤2)通过多组数据库获取与前列腺癌相关的基因,并将这些基因与复方中药活性成分的靶基因整合,获取复方中药有效成分的前列腺癌靶基因;
步骤3)通过R语言编程对复方中药活性成分的靶基因进行功能和通路的富集分析;
步骤4)基于STRING数据库构建复方中药靶基因的蛋白互作网络,并使用Cytoscape展示和构建核心蛋白质互作网络;
步骤5)基于TCMSP数据库获取的活性成分和前列腺癌靶基因的关系以及核心蛋白质互作网络,构建融合网络并绘制核心蛋白MAPK14与药物活性成分调控网络;
步骤6)从RSCB数据库获取MAPK14蛋白质的三维结构信息;根据MAPK14与药物活性成分网络,从NCBI的PubChem数据库获取活性成分的药物结构信息;基于AutoDock Tools和Vina以及Perl语言对药物分子进行批量分子对接,筛选出与MAPK14具有最优结合能力的目标化合物;并通过Pymol和LigPlot展示目标化合物的结合方式;
步骤7)通过Gromacs软件对目标化合物和MAPK14进行分子动力学模拟,并进行RMSD、范德华力和静电作用力的分析;所述目标化合物为Shinflavanone。
3.根据权利要求2所述的一种前列腺癌MAPK14抑制剂的筛选方法,其特征在于,步骤1)所述筛选条件为:OB>30%、DL>0.18。
4.根据权利要求2所述的一种前列腺癌MAPK14抑制剂的筛选方法,其特征在于,步骤2)所述多组数据库包括GeneCard、OMIM、PharmGkb、Therapeutic Targets database、DrugBank。
5.权利要求1所述的一种前列腺癌MAPK14抑制剂在制备预防或治疗前列腺癌的药物中的应用。
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