[发明专利]一种SH3TC2基因致病突变体及其在制备腓骨肌萎缩症4C型诊断试剂盒中的应用在审
申请号: | 202211039435.8 | 申请日: | 2022-08-29 |
公开(公告)号: | CN115927354A | 公开(公告)日: | 2023-04-07 |
发明(设计)人: | 曾桥;邓亚兰;吴伟娟;王维 | 申请(专利权)人: | 湖南家辉生物技术有限公司 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 苏士莹 |
地址: | 410205 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 sh3tc2 基因 致病 突变体 及其 制备 腓骨 萎缩 诊断 试剂盒 中的 应用 | ||
1.一种SH3TC2致病突变基因,其特征在于,所述SH3TC2致病突变基因包括c.590_591insAATG;
所述c.590_591insAATG在登录号为NM_024577.4的6号外显子的第590位和591位间存在AATG插入突变。
2.一种SH3TC2基因致病突变体,其特征在于,所述SH3TC2基因致病突变体为复合杂合突变,包括c.590_591insAATG和c.3733_3734delGG;
所述c.590_591insAATG在登录号为NM_024577.4的6号外显子的第590位和591位间存在AATG插入突变;
所述c.3733_3734delGG在登录号为NM_024577.4的17号外显子的第3733位和3734位存在GG缺失突变。
3.扩增权利要求2所述SH3TC2基因致病突变体的引物组,其特征在于,所述引物组包括:引物对1和引物对2;
所述引物对1包括SH3TC2-1F和SH3TC2-1R;
所述引物对2包括SH3TC2-2F和SH3TC2-2R;
所述SH3TC2-1F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
所述SH3TC2-1R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
所述SH3TC2-2F的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
所述SH3TC2-2R的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
4.利用权利要求1所述SH3TC2致病突变基因或利用权利要求2所述的SH3TC2基因致病突变体或权利要求3所述的引物组在制备腓骨肌萎缩症4C型诊断试剂或试剂盒中的应用。
5.一种腓骨肌萎缩症4C型的诊断试剂盒,其特征在于,所述诊断试剂盒包括权利要求3所述的引物组。
6.根据权利要求5所述的诊断试剂盒,其特征在于,所述诊断试剂盒还包括测序引物;所述测序引物包括:引物对3和引物对4;
所述引物对3包括SH3TC2-Seq1F和SH3TC2-Seq1R;
所述引物对4包括SH3TC2-Seq2F和SH3TC2-Seq2R;
所述SH3TC2-Seq1F的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;
所述SH3TC2-Seq1R的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;
所述SH3TC2-Seq2F的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示;
所述SH3TC2-Seq2R的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。
7.根据权利要求5或6所述的诊断试剂盒,其特征在于,所述诊断试剂盒还包括c.3733_3734delGG位点阳性突变参考品DNA1和c.590_591insAATG位点阳性突变参考品DNA2;
所述DNA1的单链核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示;
所述DNA2的单链核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示。
8.一种鉴定权利要求2所述SH3TC2基因致病突变体的基因型的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
以待测样品DNA为模板,利用权利要求3所述引物组进行PCR扩增,得到扩增产物;
将扩增产物进行测序,确定SH3TC2基因致病突变体的基因型。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系以20μL计,包括10×PCR缓冲液2μL、dNTPs0.4μL、SH3TC2-1F或SH3TC2-2F0.5μL、SH3TC2-1R或SH3TC2-2R0.5μL、模板1μL、Taq酶0.2μL和余量的ddH2O。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应进程包括:95℃预变性5min;95℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸60s,30个循环;72℃反应7min。
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