[发明专利]一种先导编辑gRNA的产生方式及其用途在审
| 申请号: | 202210904650.3 | 申请日: | 2022-07-29 |
| 公开(公告)号: | CN116064517A | 公开(公告)日: | 2023-05-05 |
| 发明(设计)人: | 黄诗圣;马培翔;唐进 | 申请(专利权)人: | 之江实验室 |
| 主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N9/22;C12N15/85;C12N15/55;C07K19/00;C12N15/62;C12N5/10 |
| 代理公司: | 北京志霖恒远知识产权代理有限公司 11435 | 代理人: | 戴莉 |
| 地址: | 311121 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 先导 编辑 grna 产生 方式 及其 用途 | ||
1.一种先导编辑gRNA的产生方式,其特征在于,使用RNA聚合酶II类启动子转录先导编辑所需的pegRNA和nicking sgRNA。
2.一种分离的核酸,其特征在于,由权利要求1所述一种先导编辑gRNA的产生方式产生的前体RNA,包括:
(i)两个外显子,分为第一外显子和第二外显子;
(ii)先导编辑所需的pegRNA和nicking sgRNA;
(iii)三段Csy4识别位点,分为第一Csy4识别位点、第二Csy4识别位点和第三Csy4识别位点;
(iv)一段包含(ii)和(iii)的内含子;
所述前体RNA组成顺序依次为:第一外显子、内含子序列的前半段、第一Csy4识别位点、pegRNA、第二Csy4识别位点、nicking sgRNA、第三Csy4识别位点、内含子序列的后半段、第二外显子。
3.如权利要求2所述的一种分离的核酸,其特征在于,所述前体RNA包含的Csy4核酸内切酶识别序列包括:
(a)如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;或,
(b)与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列具有95%以上同一性、且维持被Csy4核酸内切酶识别的功能。
4.一种gRNA重组表达载体,其特征在于,表达如权利要求2所述的一种分离的核酸。
5.一种引导编辑工具,其特征在于,包括:
(i)一种融合蛋白,包括一个先导编辑器与一种核酸内切酶;
(ii)一种如权利要求2所述的一种分离的核酸。
6.如权利要求5所述的一种引导编辑工具,其特征在于,所述先导编辑器的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
7.如权利要求5所述的一种引导编辑工具,其特征在于,所述核酸内切酶的氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。
8.如权利要求5所述的一种引导编辑工具,其特征在于,所述融合蛋白使用P2A片段连接先导编辑器与核酸内切酶,其氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。
9.一种分离的编码核酸,其特征在于,编码如权利要求5所述的一种引导编辑工具中的一种融合蛋白。
10.一种编辑器重组表达载体,其特征在于,表达如权利要求9所述的一种分离的编码核酸。
11.一种表达系统,其特征在于,包含如权利要求4所述的一种gRNA重组表达载体或如权利要求10所述的一种编辑器重组表达载体,所述表达系统的宿主细胞为真核细胞或原核细胞。
12.如权利要求11所述的一种表达系统,其特征在于,所述真核细胞或原核细胞为人细胞的真核细胞。
13.如权利要求12所述的一种表达系统,其特征在于,所述人细胞的真核细胞为人胚胎肾细胞、人胚胎干细胞、人宫颈癌细胞或人骨肉瘤细胞。
14.如权利要求13所述的一种表达系统,其特征在于,所述人胚胎肾细胞、人胚胎干细胞、人宫颈癌细胞或人骨肉瘤细胞为HEK293T细胞、H1 hESC细胞、Hela细胞或U2OS细胞。
15.如权利要求1所述的一种先导编辑gRNA的产生方式、如权利要求2-3任一项所述的一种分离的核酸、如权利要求4所述的一种gRNA重组表达载体、如权利要求5-8任一项所述的一种引导编辑工具、如权利要求9所述的一种分离的编码核酸、如权利要求10所述的一种编辑器重组表达载体、如权利要求11-14任一项所述的一种表达系统在真核生物基因编辑中的用途。
16.如权利要求15所述的用途,其特征在于,所述用途包括编辑pegRNA或nickingsgRNA上含有poly(T)的位点、实现组合编辑以及实现条件性或组织特异性编辑。
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