[发明专利]一种快速获取白参菌PCR产物的方法在审
| 申请号: | 202210841926.8 | 申请日: | 2022-07-18 |
| 公开(公告)号: | CN115141822A | 公开(公告)日: | 2022-10-04 |
| 发明(设计)人: | 马布平;李春琴;李朝东;袁清风;吴霖 | 申请(专利权)人: | 毕节市农投菌业科技有限责任公司 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806 |
| 代理公司: | 重庆晶智汇知识产权代理事务所(普通合伙) 50229 | 代理人: | 李靖 |
| 地址: | 551616 贵州省毕节市*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 快速 获取 白参菌 pcr 产物 方法 | ||
一种快速获取白参菌PCR产物的方法,以白参菌的子实体作为原料,在冰浴下研磨预处理制备子实体上清液,采用2xT5 Direct PCR Mix(Plant)试剂盒对子实体上清液进行PCR反应,所述PCR反应具体是先进行预变性、然后进入变性、退火和延伸的循环中,循环结束后进行终延伸,循环中退火温度控制为56℃,退火时间为10s。本发明通过采用特定的白参菌子实体作为原料,再以特定的2xT5 Direct PCR Mix(Plant)试剂盒进行质扩获取PCR产物,方法较现有技术简单、高效,获取白参菌PCR产物的纯度和浓度高,ITS鉴定时间缩短一半,为后续分子鉴定工作、基因检测、寻找特异性片段等工作提高了准确性和高效性。
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种快速获取白参菌PCR产物的方法。
背景技术
基因工程流程的第一步就是获得目的DNA片段,如何获得DNA片段就成为基因工程的关键问题。所需目的基因的来源不外乎分离自然存在的基因或人工合成基因。常用的方法有PCR法、化学合成法、cDNA法及建立基因文库法。PCR技术是聚合酶的链式反应,是一种在体外扩增特定基因或DNA序列的方法,只要直接目的基因的核苷酸序列,就可以利用PCR技术,将该片段扩增至数十万倍,乃至数千万倍。PCR技术不仅可以用来扩增、分离和筛选目标基因,而且在临床医疗诊断、基因突变与检测、分子进化研究等诸多领域有着重要用途。传统的PCR反应中,需要将DNA序列作为PCR底物,这导致在PCR扩增反应之前,需要进行DNA的提取,步骤繁琐、耗时较长。
针对白参菌(裂褶菌)的PCR产物提取,现有技术中是以白参菌的菌丝作为原料,需要进行DNA的提取,然后采用PCR试剂盒对DNA进行PCR扩增反应,但是获得的PCR产物中含有苹果酸、蛋白质、多糖等物质,使其纯度较低,且提取的浓度较低,造成后续无法继续使用。
发明内容
本发明目的在于提供一种快速获取白参菌PCR产物的方法。无需提取DNA就可以获得高纯度、高浓度的PCR产物。
本发明目的通过如下技术方案实现:
一种快速获取白参菌PCR产物的方法,其特征在于:在冰浴下研磨预处理制备子实体上清液,采用2xT5 Direct PCR Mix(Plant)试剂盒对子实体上清液进行PCR反应,所述PCR反应具体是先进行预变性、然后进入变性、退火和延伸的循环中,循环结束后进行终延伸,循环中退火温度控制为56℃,退火时间为10s,,循环次数为42-45次。
2xT5 Direct PCR Mix(Plant)试剂盒为市售产品,是一种无须提取DNA,可以直接进行PCR反应的试剂盒,但是该试剂盒主要适用于叶片、种子等为原料的植物,而应用于白参菌中未见报道,白参菌获取PCR产物往往采用其菌丝体作为原料进行PCR反应,在研究过程中发现,该试剂盒直接用于白参菌扩增,无法获得PCR产物。
本发明中以白参菌子实体为原料,同时通过针对白参菌子实体调整试剂盒对于的适宜反应条件,从而获得高纯度、高浓度的PCR产物。而该路线以白参菌菌丝体为原料直扩时,获得PCR产物杂质较多,纯度低。
进一步,上述PCR反应中的预变性具体是在98℃下变性3min,循环结束后在72℃下延伸3-5min。
进一步,上述循环过程中变性温度为98℃,时间为10s,退火温度控制为56℃,退火时间为10s,延伸温度为72℃、时间为20-30s。
进一步,上述白参菌子实体研磨预处理的冰浴温度为-20℃,研磨时间为2min,研磨结束后,取1研磨后的白参菌子实体浸于ddH2O中,上下颠倒混匀后,简短离心,研磨后的白参菌子实体与ddH2O的质量体积比为1mg:5uL。
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