[发明专利]NPEPL1基因突变体及其在掌跖角化症诊断中的应用在审

专利信息
申请号: 202210821627.8 申请日: 2022-07-13
公开(公告)号: CN115992119A 公开(公告)日: 2023-04-21
发明(设计)人: 崔勇;薛珂;许静凯;左先波;李明 申请(专利权)人: 中日友好医院(中日友好临床医学研究所)
主分类号: C12N9/48 分类号: C12N9/48;C12Q1/6883;C12N15/11
代理公司: 北京远大卓悦知识产权代理有限公司 11369 代理人: 卞静静
地址: 100029 北京*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: npepl1 基因 突变体 及其 角化 诊断 中的 应用
【说明书】:

发明公开了一种NPEPL1基因突变体,NPEPL1基因突变体的DNA序列与SEQ IDNO:1相比,具有c.507+713AG、c507+590‑507+592delTGT、c507+689‑507+692delTGTT突变中的任意一种或任意两种的组合,公开了NPEPL1基因突变体在掌跖角化症诊断中的应用,能够缩小检测范围,降低患者的经济负担;公开了用于检测NPEPL1基因突变体的试剂盒及其使用方法。

技术领域

本发明涉及生物技术领域,更具体地,涉及一种NPEPL1基因突变体及其在掌跖角化症诊断中的应用。

背景技术

长岛型掌跖角化症又称Nagashima掌跖角化症,其遗传模式是常染色体隐性遗传,纯合子或复合杂合子可以引起掌跖角化过度关键致病基因突变。Nagashima掌跖角化症的主要临床表现为手、足背、前臂、肘部、跟腱和膝盖部位弥漫性红斑,边界清晰。因其临床表型和遗传特点,严重影响患者的生存质量,作为一种单基因遗传病,致病突变的发现,对于患者优生优育有着重要的指导意义。

目前研究已经发现SERPINB7基因(丝氨酸蛋白酶抑制剂B7基因)多个突变可以导致Nagashima掌跖角化症的发生,在发现的突变位点中,除了外显子突变,部分患者还存在内含子变异,比如c.455-1GA和c.336+2TG,这可能导致SERPINB7基因功能改变,从而引起Nagashima掌跖角化症的致病。但在临床就诊的患者中,很多高度疑似Nagashima掌跖角化症的患者并未检测出致病突变,对于此类患者在中国人群以及亚洲人群的尚未明确的指导,传统方式会进行所有皮肤遗传病致病基因的筛查,给患者造成了巨大的经济负担。同时,此类患者可能存在其他致病基因的突变,且可能存在于不限于外显子,比如内含子区域。NPEPL1基因(氨肽酶类蛋白-1)位于20号染色体上,位于Syntaxin16基因又称STX16(突触融合蛋白16基因)和鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白)基因之间,并广泛表达于全身88个组织和器官。在全基因组检测数据中发现NPEPL1基因中有3个内含子突变,在不同Nagashima掌跖角化症患者中以单个或两个突变位点组合的方式出现。因此,为实现大量患者精准诊断,让患者在诊疗中少走弯路,进而减轻患者的经济负担。本发明整理了全基因组测序发现的NPEPL1基因的三个有意义的内含子突变位点,并设计一个检测诊断试剂盒。若Nagashima掌跖角化症患者携带单个或两个突变位点,则在众多类型的掌跖角化症的诊断中,可以优先考虑Nagashima掌跖角化症。

发明内容

本发明的一个目的是解决至少上述问题,并提供至少后面将说明的优点。

本发明还有一个目的是提供一种NPEPL1基因突变体,与野生型NPEPL1基因相比,NPEPL1基因突变体具有c.507+713AG、c507+590-507+592delTGT、c507+689-507+692delTGTT突变中的任意一种或任意两种的组合;

本发明还有一个目的是提供一种NPEPL1基因突变体在诊断掌跖角化症诊断中的应用,与野生型基因相对比,通过基因测序检测NPEPL1基因突变体具有c.507+713AG、c507+590-507+592delTGT、c507+689-507+692delTGTT突变中的任意一种或任意两种的组合,则在众多类型的掌跖角化症的诊断中,可以优先考虑Nagashima掌跖角化症;

本发明还有一个目的是提供一种用于检测NPEPL1基因突变体的试剂盒,通过检测患者是否携带本发明中涉及的NPEPL1基因中3个基因组突变位点,进而诊断患者是否为Nagashima掌跖角化症。

为了实现根据本发明的这些目的和其它优点,提供一种NPEPL1基因突变体,NPEPL1基因突变体的DAN序列与SEQ ID NO:1相比,具有c.507+713AG、c507+590-507+592delTGT、c507+689-507+692delTGTT突变中的任意一种或任意两种的组合。

NPEPL1基因突变体在掌跖角化症诊断中的应用。

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