[发明专利]CKAP4蛋白的应用、产品、表达干扰试剂及预后模型构建方法

说明书

本发明涉及CKAP4蛋白的应用、产品、表达干扰试剂及预后模型构建方法，以解决胶质母细胞瘤治疗、恶化发展的监测及预后缺乏有效手段监测的技术问题。CKAP4蛋白的应用是作为胶质母细胞瘤特异性分子标记物。产品包括检测CKAP4表达水平的试剂。CKAP4的表达干扰试剂在制备抑制胶质母细胞瘤恶化的药物组合物中的应用。预后模型构建方法包括：1、获取mRNA表达数据；2、对mRNA测序数据进行整合；3、获取CKAP4表达水平相关的因素；4、获取胶质母细胞瘤预后的不良因素；5、获取胶质母细胞瘤预后的独立危险因素；6、构建胶质母细胞瘤患者生存概率的预测列线图，获得预后模型。

技术领域

本发明涉及生物医学领域，具体涉及CKAP4的检测试剂、产品、表达干扰试剂、表达水平检测方法及预后模型构建方法。

背景技术

胶质母细胞瘤(Glioblasto mamultiform,GBM)作为最常见的中枢神经系统恶性肿瘤，是胶质瘤中恶性程度最高IV级胶质瘤(世界卫生组织，2007)。GBM重要的生物学特征是侵袭性生长，易复发和肿瘤组织内部细胞异质性，尤其高级别胶质母细胞瘤恶化迅速，并可能在初始治疗8-9个月后复发。然而，现在对胶质母细胞瘤治疗、预后以及恶化发展的监测依然缺乏有效的手段。

CKAP4(cytoskeleton-associated protein 4)，也称为p63和CLIP-63，是一种位于内质网(ER)膜中的II型跨膜蛋白，在癌症发生发展过程中发挥重要调控作用。

发明内容

本发明目的在于解决胶质母细胞瘤治疗、恶化发展的监测及预后缺乏有效手段监测的技术问题，提供一种CKAP4蛋白的应用、产品、表达干扰试剂及预后模型构建方法。

本发明的技术方案为：

本发明提供了一种CKAP4蛋白的应用，其特殊之处在于：所述CKAP4蛋白作为胶质母细胞瘤特异性分子标记物。

进一步地，所述CKAP4蛋白作为监测胶质母细胞瘤发展进程的分子靶标。

进一步地，通过检测CKAP4表达水平诊断胶质母细胞瘤。

进一步地，所述CKAP4表达水平检测方法包括基于质谱的无标记定量分析、免疫印迹。

本发明还提供了一种诊断胶质母细胞瘤的产品，其特殊之处在于：所述产品包括检测CKAP4表达水平的试剂。具体的，所述产品可以是用于诊断胶质母细胞瘤的试剂盒或芯片。

本发明还提供了CKAP4的表达干扰试剂在制备抑制胶质母细胞瘤恶化的药物组合物中的应用。

进一步地，所述CKAP4的表达干扰试剂为siRNA-CKAP4，其序列为：GCAGGAUUUGAAAGCCUUATT,sense；UAAGGCUUUCAAAUCCUGCTT,antisense。

本发明还提供了一种基于CKAP4的胶质母细胞瘤预后模型的构建方法，其特殊之处在于，包括以下步骤：

S1、获取多个胶质母细胞瘤患者的胶质瘤样本，采集胶质瘤样本的mRNA表达谱获取mRNA表达数据，并分别与各个胶质瘤样本对应的临床数据匹配；

S2、采用ComBat函数消除不同批次胶质瘤样本之间的批次效应，实现对胶质瘤样本的mRNA测序数据进行整合；

S3、根据年龄高或低、性别、胶质瘤级别高或低、治疗方式放疗和/或化疗、IDH1突变型或野生型、X1p19q共缺失或非共缺失以及MGMT的启动子甲基化或启动子未甲基化分别与CKAP4表达水平的统计学差异性，得到年龄高或低、胶质瘤级别高或低、IDH1突变型或野生型、X1p19q共缺失或非共缺失以及MGMT启动子甲基化或启动子未甲基化为CKAP4表达水平相关的因素；