[发明专利]用于无细胞DNA的定量遗传分析的方法在审
| 申请号: | 202210630244.2 | 申请日: | 2014-08-22 |
| 公开(公告)号: | CN115029342A | 公开(公告)日: | 2022-09-09 |
| 发明(设计)人: | 克里斯多弗·K·雷蒙德;林继力;克里斯多弗·D·阿莫尔 | 申请(专利权)人: | 分析生物科学有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806;C12Q1/6869;G16B20/00;G16B25/00;G16B30/00 |
| 代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
| 地址: | 美国华*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 细胞 dna 定量 遗传 分析 方法 | ||
1.用于无细胞DNA(cfDNA)的遗传分析的方法,其包括:
(a)用一种或多种末端修复酶处理cfDNA以产生末端修复的cfDNA;
(b)将一个或多个衔接子连接到所述末端修复的cfDNA的每个末端以产生cfDNA文库;
(c)扩增所述cfDNA文库以产生cfDNA文库克隆;
(d)测定cfDNA克隆文库中基因组当量的数量;
(e)对所述cfDNA文库克隆中一个或多个靶遗传基因座进行定量遗传分析。
2.如权利要求1所述的方法,其还包括从对象的生物样本中分离cfDNA。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中从生物样本中分离所述cfDNA,所述生物样本选自:羊水、血液、血浆、血清、精液、淋巴液、脑脊髓液、眼内液、尿、唾液、粪便、粘液和汗液。
4.如权利要求1-3中任一项所述的方法,其中所述一个或多个衔接子包含多个衔接子种类。
5.如权利要求1-4中任一项所述的方法,其中所述一个或多个衔接子各自包含用于扩增所述cfDNA文库的引物结合位点。
6.如权利要求1-5中任一项所述的方法,其中所述一个或多个衔接子各自包含一个或多个独特读取编码。
7.如权利要求1-6中任一项所述的方法,其中所述一个或多个衔接子各自包含用于样本多重分析的一个或多个样本编码。
8.如权利要求1-6中任一项所述的方法,其中所述一个或多个衔接子各自包含用于DNA测序的一个或多个序列。
9.预测、诊断或监测对象的遗传疾病的方法,其包括:
(a)从对象的生物样本中分离或获得cfDNA;
(b)用一种或多种末端修复酶处理所述cfDNA以产生末端修复的cfDNA;
(c)将一个或多个衔接子连接到所述末端修复的cfDNA的每个末端以产生cfDNA文库;
(d)扩增所述cfDNA文库以产生cfDNA克隆文库;
(e)测定所述cfDNA克隆文库中基因组当量的数量;和
(f)对所述cfDNA克隆文库中与所述遗传疾病相关的一个或多个靶遗传基因座进行定量遗传分析,其中鉴定或检测到所述一个或多个靶遗传基因座中的一个或多个遗传损伤预测出所述遗传疾病、诊断出所述遗传疾病或监测到所述遗传疾病的进展。
10.用于遗传疾病的伴随诊断方法,其包括:
(a)从对象的生物样本中分离或获得cfDNA;
(b)用一种或多种末端修复酶处理所述cfDNA以产生末端修复的cfDNA;
(c)将一个或多个衔接子连接到所述末端修复的cfDNA的每个末端以产生cfDNA文库;
(d)扩增所述cfDNA文库以产生cfDNA克隆文库;
(e)测定所述cfDNA克隆文库中基因组当量的数量;和
(f)对所述cfDNA克隆文库中与所述遗传疾病相关的一种或多种生物标记进行定量遗传分析,其中检测或未检测到所述一种或多种生物标记中的至少一种指示所述对象是否应针对所述遗传疾病进行治疗。
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