[发明专利]复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法

说明书

本发明公开了复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法，包括以下步骤，步骤1、获取CRC中相关靶点的数据，基于差异基因筛选技术分别筛选出关键基因；步骤2、获取复方斑蝥胶囊中十一味中药靶点的数据，对复方斑蝥胶囊进行作用靶点预测，判断其是否可以发挥治疗癌症的作用；步骤3、对复方斑蝥胶囊中君臣佐使药物进行化合物挖掘，并进行ADME活性筛选和药物靶点预测；将预测所得药物靶点与CRC的关键基因进行映射，从而找到治疗靶点；步骤4、判断治疗靶点是否可以发挥治疗CRC的作用；本发明从小分子活性化合物的层面探索复方斑蝥胶囊治疗CRC的作用机理，可以筛选结直肠癌的关键基因，提供了复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的具体筛选方法。

技术领域

本发明涉及药物靶点筛选技术领域，具体涉及复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法。

背景技术

结直肠癌(Colorectal Cancer，缩写CRC)作为常见的恶性肿瘤之一，发病率和死亡率较高，但其具体病因和发病机制不详。中医认为，结直肠癌属于“肠蕈”、“积聚”、“癌病”等范畴。结直肠癌的风险因素包括遗传、癌前病变、生活方式、饮食习惯等。结直肠癌的早期症状并不明显，除了结肠镜检查外，还可以通过实验室检查、影像学检查、免疫组化检查和基因检测等方式进行辅助诊断。目前治疗方式包括内镜治疗、手术治疗、放射治疗、药物治疗和中医中药治疗。虽然结直肠癌是局部区域的病变，但中医理论认为实则是全身性疾病在局部的反映。

中医药是中华民族的瑰宝，复方斑蝥胶囊由11味中药组成，具有破血消淤、攻毒蚀疮的功效，可用于治疗多种癌症，但是该中成药如何通过多靶点、多通路发挥抗肿瘤效应的分子作用机制有待深入。

本发明提供了一种复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,可以筛选结直肠癌的关键基因，为该疾病的预防、诊断和治疗提供理论依据；此外，还可以探究复方斑蝥胶囊中每一味中药中的活性化合物、作用靶点和作用通路，以明确该中成药治疗结直肠癌的分子机制，为指导其应用于结直肠癌的治疗奠定理论基础。

发明内容

本发明的发明目的是提供复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法，包括以下步骤，

步骤1、获取CRC中相关靶点的数据，基于差异基因筛选技术分别筛选出关键基因；对筛选后的关键基因进行生存曲线分析、功能富集分析和蛋白质互作网络构建，提取出核心基因；

步骤2、获取复方斑蝥胶囊中十一味中药靶点的数据，对复方斑蝥胶囊进行作用靶点预测，并针对作用靶点构建中药-靶点网络、蛋白质互作网络和中药-核心基因-癌症网络，判断其是否可以发挥治疗癌症的作用；

步骤3、对复方斑蝥胶囊中君臣佐使药物进行化合物挖掘，并进行ADME活性筛选和药物靶点预测；将预测所得药物靶点与CRC的关键基因进行映射，从而找到治疗靶点；

步骤4、对治疗靶点进行中药-活性化合物-靶点网络构建、功能富集分析和蛋白质互作网络构建，判断其是否可以发挥治疗CRC的作用。

优选地，所述步骤1中，还包括，

对GEO数据库进行CRC的差异基因筛选，得到第一数据集；

对TCGA数据库进行CRC的差异基因筛选，得到第二数据集；

将第一数据集与第二数据集映射成韦恩图，得到交集基因，所述交集基因为上述关键基因。

优选地，所述步骤2中，获取复方斑蝥胶囊中十一味中药靶点的数据的步骤为，通过本草组鉴数据库收集复方斑蝥胶囊的所有靶点，再通过Metascape数据库进行校正，剔除掉不属于人源的靶点。

优选地，所述步骤2中，还包括对预测的作用靶点构建的蛋白互作网络进行MCODE模块分析，并对得分最高模进行功能富集分析。

优选地，还包括，步骤5、通过分子对接技术，进行活性化合物与相关靶点的亲和力验证。