[发明专利]复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法在审
申请号: | 202210586319.1 | 申请日: | 2022-05-26 |
公开(公告)号: | CN115083526A | 公开(公告)日: | 2022-09-20 |
发明(设计)人: | 魏龙;杨欢 | 申请(专利权)人: | 江苏大学 |
主分类号: | G16B50/00 | 分类号: | G16B50/00;G16B40/00;G16H50/70;G16H70/40 |
代理公司: | 苏州翔远专利代理事务所(普通合伙) 32251 | 代理人: | 陆金星 |
地址: | 212000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 复方 斑蝥 胶囊 用于 crc 核心 基因 筛选 方法 | ||
1.复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤,
步骤1、获取CRC中相关靶点的数据,基于差异基因筛选技术分别筛选出关键基因;对筛选后的关键基因进行生存曲线分析、功能富集分析和蛋白质互作网络构建,提取出核心基因;
步骤2、获取复方斑蝥胶囊中十一味中药靶点的数据,对复方斑蝥胶囊进行作用靶点预测,并针对作用靶点构建中药-靶点网络、蛋白质互作网络和中药-核心基因-癌症网络,判断其是否可以发挥治疗癌症的作用;
步骤3、对复方斑蝥胶囊中君臣佐使药物进行化合物挖掘,并进行ADME活性筛选和药物靶点预测;将预测所得药物靶点与CRC的关键基因进行映射,从而找到治疗靶点;
步骤4、对治疗靶点进行中药-活性化合物-靶点网络构建、功能富集分析和蛋白质互作网络构建,判断其是否可以发挥治疗CRC的作用。
2.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,所述步骤1中,还包括,
对GEO数据库进行CRC的差异基因筛选,得到第一数据集;
对TCGA数据库进行CRC的差异基因筛选,得到第二数据集;
将第一数据集与第二数据集映射成韦恩图,得到交集基因,所述交集基因为上述关键基因。
3.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,所述步骤2中,获取复方斑蝥胶囊中十一味中药靶点的数据的步骤为,通过本草组鉴数据库收集复方斑蝥胶囊的所有靶点,再通过Metascape数据库进行校正,剔除掉不属于人源的靶点。
4.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,所述步骤2中,还包括对预测的作用靶点构建的蛋白互作网络进行MCODE模块分析,并对得分最高模进行功能富集分析。
5.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,还包括,步骤5、通过分子对接技术,进行活性化合物与相关靶点的亲和力验证。
6.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,所述步骤1中,还包括,基于差异基因筛选技术筛选的同时进行WGCNA分析。
7.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,步骤2中,将作用靶点通过毒物遗传数据库进行疾病预测后,构建中药-核心基因-癌症网络。
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