[发明专利]复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法在审

专利信息
申请号: 202210586319.1 申请日: 2022-05-26
公开(公告)号: CN115083526A 公开(公告)日: 2022-09-20
发明(设计)人: 魏龙;杨欢 申请(专利权)人: 江苏大学
主分类号: G16B50/00 分类号: G16B50/00;G16B40/00;G16H50/70;G16H70/40
代理公司: 苏州翔远专利代理事务所(普通合伙) 32251 代理人: 陆金星
地址: 212000 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 复方 斑蝥 胶囊 用于 crc 核心 基因 筛选 方法
【权利要求书】:

1.复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤,

步骤1、获取CRC中相关靶点的数据,基于差异基因筛选技术分别筛选出关键基因;对筛选后的关键基因进行生存曲线分析、功能富集分析和蛋白质互作网络构建,提取出核心基因;

步骤2、获取复方斑蝥胶囊中十一味中药靶点的数据,对复方斑蝥胶囊进行作用靶点预测,并针对作用靶点构建中药-靶点网络、蛋白质互作网络和中药-核心基因-癌症网络,判断其是否可以发挥治疗癌症的作用;

步骤3、对复方斑蝥胶囊中君臣佐使药物进行化合物挖掘,并进行ADME活性筛选和药物靶点预测;将预测所得药物靶点与CRC的关键基因进行映射,从而找到治疗靶点;

步骤4、对治疗靶点进行中药-活性化合物-靶点网络构建、功能富集分析和蛋白质互作网络构建,判断其是否可以发挥治疗CRC的作用。

2.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,所述步骤1中,还包括,

对GEO数据库进行CRC的差异基因筛选,得到第一数据集;

对TCGA数据库进行CRC的差异基因筛选,得到第二数据集;

将第一数据集与第二数据集映射成韦恩图,得到交集基因,所述交集基因为上述关键基因。

3.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,所述步骤2中,获取复方斑蝥胶囊中十一味中药靶点的数据的步骤为,通过本草组鉴数据库收集复方斑蝥胶囊的所有靶点,再通过Metascape数据库进行校正,剔除掉不属于人源的靶点。

4.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,所述步骤2中,还包括对预测的作用靶点构建的蛋白互作网络进行MCODE模块分析,并对得分最高模进行功能富集分析。

5.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,还包括,步骤5、通过分子对接技术,进行活性化合物与相关靶点的亲和力验证。

6.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,所述步骤1中,还包括,基于差异基因筛选技术筛选的同时进行WGCNA分析。

7.如权利要求1所述的复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法,其特征在于,步骤2中,将作用靶点通过毒物遗传数据库进行疾病预测后,构建中药-核心基因-癌症网络。

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