[发明专利]网络药理学在分析虾青素抗皮肤炎作用靶点与机制中的应用方法在审

专利信息
申请号: 202210232324.2 申请日: 2022-03-07
公开(公告)号: CN114724621A 公开(公告)日: 2022-07-08
发明(设计)人: 黎荣;黎镜波;苏敏;聂丽涛;梁霄 申请(专利权)人: 桂林医学院
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B50/00
代理公司: 广西中知华誉知识产权代理有限公司 45140 代理人: 梁秀新
地址: 541000 广西壮族*** 国省代码: 广西;45
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摘要:
搜索关键词: 网络 药理学 分析 虾青素抗 皮肤 作用 机制 中的 应用 方法
【权利要求书】:

1.网络药理学在分析虾青素抗皮肤炎作用靶点与机制中的应用方法,其特征在于:包括如下步骤:

1)虾青素作用靶点筛选:

以虾青素为研究目标,运用在线数据库筛选该物质的作用靶点;

2)疾病作用靶点筛选:

以皮肤炎为研究目标,在疾病数据库中查找皮肤炎靶点;

3)获取药物-疾病交集靶基因及筛选核心靶点:将步骤1)和步骤2)所得的靶点进行交集映射,获得虾青素抗皮肤炎作用靶点;

运用STRING数据库分析交集靶点,并取得靶点蛋白互作网络关系图(PPI网络)及tsv.数据文件;

核心靶点采用Cytoscape3.7.1软件进行筛选;

4)对核心靶点富集分析以探讨药物成分作用机制:

基于R软件及相关语言包对核心靶标进行GO生物过程及KEGG信号通路分析,得到相应图表,并根据结果进行虾青素抗皮肤炎作用机制分析;

5)“药物-靶点-生物过程-信号通路-疾病”网络可视化:

运用Cytoscape根据步骤4)结果构建“药物-靶点-生物过程-信号通路-疾病”可视化图,对虾青素抗皮肤炎作用机理分析。

2.根据权利要求1所述的网络药理学在分析虾青素抗皮肤炎作用靶点与机制中的应用方法,其特征在于:步骤1)所述的在线数据库,选自Swiss Target Prediction和BATMAN。

3.根据权利要求1所述的网络药理学在分析虾青素抗皮肤炎作用靶点与机制中的应用方法,其特征在于:步骤2)所述的疾病数据库,选自Genecard、OMIM、Therapeutic TargetDatabase和PharmGkb。

4.根据权利要求1所述的网络药理学在分析虾青素抗皮肤炎作用靶点与机制中的应用方法,其特征在于:步骤2)所述的核心靶点采用Cytoscape3.7.1软件进行筛选,是采用Cytoscape3.7.1软件根据网络节点的拓扑结构参数,进行核心靶点筛选。

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