[发明专利]一种筛选并确定与特定抗原相互作用的TCR及其与特定抗原相互作用强度的方法在审

专利信息
申请号: 202210209696.3 申请日: 2022-03-04
公开(公告)号: CN115792238A 公开(公告)日: 2023-03-14
发明(设计)人: 蓝勋;王莉惠 申请(专利权)人: 清华大学
主分类号: G01N33/68 分类号: G01N33/68;C07K14/725;C12N1/19;C12Q1/6869;C12R1/865
代理公司: 北京市金杜律师事务所 11256 代理人: 邰红
地址: 100084*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 筛选 确定 特定 抗原 相互作用 tcr 及其 强度 方法
【权利要求书】:

1.一种筛选并确定与特定抗原相互作用的TCR及其与特定抗原相互作用强度的方法,其包括:

(a)将所述特定抗原-MHC复合物(pMHC)和TCR文库分别展示到不同交配型酵母表面;

(b)共培养所述不同交配型酵母;

(c)筛选出酵母细胞二倍体,并确定出所述酵母细胞二倍体中的TCR序列;

(d)计算所述确定出的每种TCR序列的差异倍数(fold change)值;

由此确定出与特定抗原相互作用的TCR及其与特定抗原相互作用强度;

优选地,所述展示TCR的酵母细胞以整合形式表达TCR;

优选地,所述展示pMHC的酵母细胞以整合形式表达pMHC。

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述交配缺陷型酵母细胞是Sag1基因缺失的酵母细胞。

3.根据权利要求1-2所述的方法,其中所述酵母细胞是酿酒酵母,优选所述酿酒酵母为EBY100菌株或EBY100菌株的遗传改造菌株。

4.根据权利要求1-3所述的方法,其中确定所述酵母细胞二倍体的TCR和pMHC的序列是使用二代测序方法进行确定。

5.根据权利要求1-4的方法筛选出的TCR序列。

6.一种共培养物,其包含展示一种特定抗原-MHC复合物(pMHC)的酵母细胞和展示多种TCR的酵母细胞,其中展示TCR的酵母细胞和展示pMHC的酵母细胞属于不同的交配型;

其中所述酵母细胞是交配缺陷型的;

优选地,所述展示TCR的酵母细胞是以整合形式表达TCR;

优选地,所述展示pMHC的酵母细胞是以整合形式表达pMHC。

7.根据权利要求6所述的共培养物,其在用于筛选能够与一种特定抗原结合的TCR序列的用途。

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