[发明专利]耳聋致病分析等级分类方法、装置、计算机可读存储介质及服务器在审
申请号: | 202210051507.4 | 申请日: | 2022-01-17 |
公开(公告)号: | CN114496072A | 公开(公告)日: | 2022-05-13 |
发明(设计)人: | 赵贵虎;李津臣;袁永一;黄莎莎;戴朴 | 申请(专利权)人: | 北京安琪尔基因医学科技有限公司;中南大学湘雅医院;中国人民解放军总医院第一医学中心 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20;G16B20/30;G16B40/00;G16B50/00 |
代理公司: | 北京知果之信知识产权代理有限公司 11541 | 代理人: | 高科 |
地址: | 102600 北京市大*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 耳聋 致病 分析 等级 分类 方法 装置 计算机 可读 存储 介质 服务器 | ||
本申请公开了一种耳聋致病分析等级分类方法、装置、计算机可读存储介质及服务器。该耳聋致病分析等级分类方法包括:接收耳聋相关的基因变异数据;根据用户选择的注释信息给所述基因变异数据做注释;通过预设的ACMG模型分析注释后的基因变异数据,并根据分析结果确定耳聋致病等级。本申请解决了由于没有构建相应的模型进行数据分析,也就不能探究基因变异和耳聋的关联性,造成的给人员进一步研究或参考带来了极大的技术问题。
技术领域
本申请涉及数据分析领域,具体而言,涉及一种耳聋致病分析等级分类方法、装置、计算机可读存储介质及服务器。
背景技术
发明人发现,耳聋致病大多数与遗传学基因变异相关,一些数据库收录了这些与耳聋相关的基因变异数据,并且能够通过相应的注释信息进行注释,但是并没有构建相应的模型进行数据分析,也就不能探究基因变异和耳聋的关联性,给研人员进一步研究或参考带来了极大的不便。
针对相关技术中没有构建相应的模型进行数据分析,也就不能探究基因变异和耳聋的关联性,给研人员进一步研究或参考带来了极大的不便的问题,目前尚未提出有效的解决方案。
发明内容
本申请的主要目的在于提供一种耳聋致病分析等级分类方法、装置、计算机可读存储介质及服务器,以解决没有构建相应的模型进行数据分析,也就不能探究基因变异和耳聋的关联性,给人员进一步研究或参考带来了极大的不便的问题。
为了实现上述目的,根据本申请的一个方面,提供了一种耳聋致病分析等级分类方法、装置、计算机可读存储介质及服务器。
根据本申请的耳聋致病分析等级分类方法包括:接收耳聋相关的基因变异数据;根据用户选择的注释信息给所述基因变异数据做注释;通过预设的ACMG 模型分析注释后的基因变异数据,并根据分析结果确定耳聋致病等级。
进一步的,注释的内容包括:变异的功能影响;变异和基因水平影响的疾病和表型相关信息;硅预测算法的结果;公共数据库不同人群等位基因频率;有意义的基因水平信息;药物-基因相互作用和精准药物能力。
进一步的,通过预设的ACMG模型分析注释后的基因变异数据,并根据分析结果确定耳聋致病等级包括:根据注释后的基因变异数据筛选出致病变异位点;利用预设的评估软件评估所述致病变异位点;使用预设的位点变异功能预测软件进行基因变异导致功能改变预测;根据预测结果在预设的ACMG证据明细表中查找致病性证据;基于所述致病性证据查找遗传变异分类表,确定耳聋致病等级。
进一步的,所述评估软件包括以下的一种或多种:Deafness Variation Database(DVD)、Hereditary Hearing Loss(HHL)、Online Mendelian Inheritance in Man(OMIM)、Gene4HL。
进一步的,所述位点变异功能预测软件包括以下的一种或多种:CADD、ReVe、SIFT、Polyphen2、LRT、MutationTaster、FATHMM。
进一步的,供用户选择的注释信息包括以下的一种或多种:参考基因组、剪接阈值和变异水平、识别共分离、基本信息、错义变异的致病性预测、不同群体中的等位基因频率、相关临床数据库、罕见有害变异。
为了实现上述目的,根据本申请的另一方面,提供了一种耳聋致病分析装置。
根据本申请的耳聋致病分析装置包括:接收模块,用于接收耳聋相关的基因变异数据;注释模块,用于根据用户选择的注释信息给所述基因变异数据做注释;处理确定模块,用于通过预设的ACMG模型分析注释后的基因变异数据,并根据分析结果确定耳聋致病等级。
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