[发明专利]一种基于磁珠法的高通量植物组织基因组DNA提取方法在审
申请号: | 202210025331.5 | 申请日: | 2022-01-11 |
公开(公告)号: | CN114231525A | 公开(公告)日: | 2022-03-25 |
发明(设计)人: | 陈丽婷;匡猛;黄龙雨;吴立强;黄义文;彭军;周大云;吴玉珍 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院棉花研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京盛询知识产权代理有限公司 11901 | 代理人: | 袁善民 |
地址: | 455000 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 磁珠法 通量 植物 组织 基因组 dna 提取 方法 | ||
本发明公开了一种基于磁珠法的高通量植物组织基因组DNA提取方法,属于分子生物学领域。本发明具体公开一种DNA提取液,包括:(a)所述DNA提取液包括如下组分:NaCl,Tris‑HCl,EDTA,CTAB,山梨醇和PVP;(b)所述DNA提取液包括如下组分:NaCl,Tris‑HCl,EDTA,SDS,山梨醇和PVP。本发明基于磁珠法,利用上述DNA提取液结合移液工作台,克服了传统方法耗时费力、手工操作步骤多、规模化标准化程度低、有机试剂对人体有害且污染环境等缺陷,DNA提取效率提高了10倍,且制备的DNA质量稳定可靠,能够满足规模化分子标记辅助育种对高通量核酸提取的需求。
技术领域
本发明涉及分子生物学领域,特别是涉及一种基于磁珠法的高通量植物组织基因组DNA提取方法。
背景技术
近年来,随着分子生物学的不断发展,棉花基因组测序、品种鉴定及群体遗传分析等研究也被广泛应用和推广。但这些技术的实现往往需要基于高纯度和高完整度的全基因组DNA,对全基因组DNA提取的通量提出了更高要求。
目前,较为成熟的DNA提取方法包括SDS法、CTAB法和试剂盒法,SDS法和CTAB法使用成本低廉,提取得到的DNA能够满足大多数分子实验的使用要求,但是其操作过程过于繁琐、耗时费力,且使用多种有毒有害的试剂,不能规模化使用。试剂盒则存在价格昂贵,使用效果因批次而异等问题,也难以供应高通量的分子生物实验使用需求。
发明内容
本发明的目的是提供一种基于磁珠法的高通量植物组织基因组DNA提取方法,以解决上述现有技术存在的问题,该方法服了传统方法耗时费力、手工操作步骤多、规模化标准化程度低、有机试剂对人体有害且污染环境等缺陷,并且DNA提取效率提高了10倍,所制备的DNA质量稳定可靠,能够满足规模化分子标记辅助育种对高通量核酸提取的需求。
为实现上述目的,本发明提供了如下方案:
本发明提供一种DNA提取液,包括如下(a)或(b)所示配方:
(a)所述DNA提取液包括如下组分:NaCl,Tris-HCl,EDTA,CTAB,山梨醇和PVP;
(b)所述DNA提取液包括如下组分:NaCl,Tris-HCl,EDTA,SDS,山梨醇和PVP。
优选的是,所所述DNA提取液包括如下组分:1.20-1.65mol/L NaCl,0.05-0.12mol/L Tris-HCl,0.01-0.03mol/L EDTA,15.00-23.00g CTAB,3.00-6.50g山梨醇和5.00-13.00g PVP。
优选的是,所述DNA提取液包括如下组分:0.50-0.85mol/L NaCl,0.02-0.07mol/LTris-HCl,0.005-0.015mol/L EDTA,8.00-15.00gSDS,3.00-6.50g山梨醇和8.00-12.00gPVP。
优选的是,还包括磁珠。
本发明还提供一种基于磁珠法的高通量植物组织基因组DNA提取方法,包括以下步骤:
(1)将植物组织和钢珠混合后再于超低温环境冷冻处理,之后再将植物组织进行研磨;
(2)研磨后的植物组织,与权利要求1所述的DNA提取液混匀后,水浴加热;
(3)水浴加热处理后的样品进行离心,再加入蛋白溶液,震荡、离心;
(4)离心后的样品,放于移液工作站提取基因组DNA。
优选的是,所述植物组织为棉花叶片或者种子。
优选的是,步骤(1)中,所述超低温环境为-80℃;所述研磨条件为:于1500rpm研磨30s;
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