[发明专利]一种基于磁珠法的高通量植物组织基因组DNA提取方法在审

专利信息
申请号: 202210025331.5 申请日: 2022-01-11
公开(公告)号: CN114231525A 公开(公告)日: 2022-03-25
发明(设计)人: 陈丽婷;匡猛;黄龙雨;吴立强;黄义文;彭军;周大云;吴玉珍 申请(专利权)人: 中国农业科学院棉花研究所
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 北京盛询知识产权代理有限公司 11901 代理人: 袁善民
地址: 455000 河*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 磁珠法 通量 植物 组织 基因组 dna 提取 方法
【说明书】:

发明公开了一种基于磁珠法的高通量植物组织基因组DNA提取方法,属于分子生物学领域。本发明具体公开一种DNA提取液,包括:(a)所述DNA提取液包括如下组分:NaCl,Tris‑HCl,EDTA,CTAB,山梨醇和PVP;(b)所述DNA提取液包括如下组分:NaCl,Tris‑HCl,EDTA,SDS,山梨醇和PVP。本发明基于磁珠法,利用上述DNA提取液结合移液工作台,克服了传统方法耗时费力、手工操作步骤多、规模化标准化程度低、有机试剂对人体有害且污染环境等缺陷,DNA提取效率提高了10倍,且制备的DNA质量稳定可靠,能够满足规模化分子标记辅助育种对高通量核酸提取的需求。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域,特别是涉及一种基于磁珠法的高通量植物组织基因组DNA提取方法。

背景技术

近年来,随着分子生物学的不断发展,棉花基因组测序、品种鉴定及群体遗传分析等研究也被广泛应用和推广。但这些技术的实现往往需要基于高纯度和高完整度的全基因组DNA,对全基因组DNA提取的通量提出了更高要求。

目前,较为成熟的DNA提取方法包括SDS法、CTAB法和试剂盒法,SDS法和CTAB法使用成本低廉,提取得到的DNA能够满足大多数分子实验的使用要求,但是其操作过程过于繁琐、耗时费力,且使用多种有毒有害的试剂,不能规模化使用。试剂盒则存在价格昂贵,使用效果因批次而异等问题,也难以供应高通量的分子生物实验使用需求。

发明内容

本发明的目的是提供一种基于磁珠法的高通量植物组织基因组DNA提取方法,以解决上述现有技术存在的问题,该方法服了传统方法耗时费力、手工操作步骤多、规模化标准化程度低、有机试剂对人体有害且污染环境等缺陷,并且DNA提取效率提高了10倍,所制备的DNA质量稳定可靠,能够满足规模化分子标记辅助育种对高通量核酸提取的需求。

为实现上述目的,本发明提供了如下方案:

本发明提供一种DNA提取液,包括如下(a)或(b)所示配方:

(a)所述DNA提取液包括如下组分:NaCl,Tris-HCl,EDTA,CTAB,山梨醇和PVP;

(b)所述DNA提取液包括如下组分:NaCl,Tris-HCl,EDTA,SDS,山梨醇和PVP。

优选的是,所所述DNA提取液包括如下组分:1.20-1.65mol/L NaCl,0.05-0.12mol/L Tris-HCl,0.01-0.03mol/L EDTA,15.00-23.00g CTAB,3.00-6.50g山梨醇和5.00-13.00g PVP。

优选的是,所述DNA提取液包括如下组分:0.50-0.85mol/L NaCl,0.02-0.07mol/LTris-HCl,0.005-0.015mol/L EDTA,8.00-15.00gSDS,3.00-6.50g山梨醇和8.00-12.00gPVP。

优选的是,还包括磁珠。

本发明还提供一种基于磁珠法的高通量植物组织基因组DNA提取方法,包括以下步骤:

(1)将植物组织和钢珠混合后再于超低温环境冷冻处理,之后再将植物组织进行研磨;

(2)研磨后的植物组织,与权利要求1所述的DNA提取液混匀后,水浴加热;

(3)水浴加热处理后的样品进行离心,再加入蛋白溶液,震荡、离心;

(4)离心后的样品,放于移液工作站提取基因组DNA。

优选的是,所述植物组织为棉花叶片或者种子。

优选的是,步骤(1)中,所述超低温环境为-80℃;所述研磨条件为:于1500rpm研磨30s;

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