[发明专利]用于检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的组合物、方法和系统

权利要求书

1.一种检测样品中的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistantStaphylococcus Aureus，MRSA)的方法，所述方法包括：

获得样品；

向所述样品中加入选择剂；

使所述样品与包含一种或多种感染原的混合物接触，其中所述感染原包含指示基因并对金黄色葡萄球菌特异，并且其中所述指示基因编码指示蛋白产物；

俘获所述指示蛋白产物；以及

检测由所述指示蛋白产物产生的信号，其中对所述信号的检测用来确定所述样品中MRSA的存在。

2.权利要求1所述的方法，其中所述选择剂包括抗生素。

3.权利要求2所述的方法，其中所述抗生素包括头孢西丁。

4.权利要求1所述的方法，其中所述样品来自鼻拭子。

5.权利要求1所述的方法，其中所述方法检测样品中少至10个、9个、8个、7个、6个、5个、4个、3个、2个或单个细菌。

6.权利要求1所述的方法，其中所述混合物包含至少两个不同类型的重组噬菌体，并且所述重组噬菌体中的至少一个来自ISP、MP115或其组合。

7.权利要求1所述的方法，其中所述指示基因进行密码子优化并且编码生成内部信号的可溶性蛋白产物或在与底物反应后生成信号的可溶性酶。

8.权利要求1所述的方法，进一步包括经密码子优化的指示基因上游的非翻译区，其中所述非翻译区包括噬菌体晚期基因启动子。

9.权利要求1所述的方法，其中所述俘获步骤包括使所述指示蛋白产物与表面接触。

10.权利要求9所述的方法，其中所述表面是微量滴定板、胶乳粒子、侧流条、珠粒、磁性粒子或浸渍试纸。

11.权利要求9所述的方法，进一步包括在俘获所述指示蛋白产物之前将固定化的结合伴侣沉积在所述表面上。

12.权利要求11所述的方法，其中所述固定化的结合伴侣是抗体或其片段。

13.权利要求11所述的方法，进一步包括洗涤包含所述固定化的结合伴侣的表面。

14.权利要求13所述的方法，进一步包括在俘获所述指示蛋白产物后洗涤所述表面。

15.权利要求1所述的方法，其中通过检测所述指示蛋白产物所产生的信号背景比为至少2.0或至少2.5。

16.权利要求1所述的方法，其中所述样品首先在有助于生长的条件下孵育持续小于24小时、23小时、22小时、21小时、20小时、19小时、18小时、17小时、16小时、15小时、14小时、13小时、12小时、11小时、10小时、9小时、8小时、7小时、6小时、5小时、4小时、3小时或2小时的富集期。

17.一种检测样品中的微生物的方法，所述方法包括：

获得样品；

使所述样品与包含一种或多种感染原的混合物接触，其中所述感染原包含指示基因并对微生物特异，并且其中所述指示基因编码指示蛋白产物；

使所述指示蛋白产物与表面接触，所述表面包含用于俘获所述指示蛋白产物的固定化的结合伴侣；以及

检测由所述指示蛋白产物产生的信号，其中对所述信号的检测用来确定所述样品中所述微生物的存在。