[发明专利]Custommune：设计个性化和群体靶向肽疫苗的网络工具

权利要求书

1.一种用于HIV/AIDS或癌症的个性化疫苗，其中候选疫苗的HLAI类和/或II类抗原的肽亲和力被预测。

2.根据权利要求1所述的个性化疫苗，包含免疫表位，其中所述免疫表位具有对HLA的肽亲和力，所述HLA是使用排除呈现记录的免疫逃逸突变的蛋白部分的算法预测的。

3.根据权利要求2所述的个性化疫苗，其中所述算法包括对最不可能突变成亲和力降低的肽进行预测，以获得候选疫苗的HLA。

4.根据权利要求2或3所述的个性化疫苗，其中在将权利要求2和3所述的两个参数纳入考虑范围的情况下对候选肽进行评分。

5.根据权利要求4所述的个性化疫苗，其中算法包括通过理论突变体的亲和力程度来计算潜在逃逸突变体的亲和力。

6.一种提供一组用作抗冠状病毒的疫苗的肽的方法，包括以下步骤：

A)收集人类群体/社区中最流行的II类HLA，和

B)对来自氨基酸范围为397-437和455-492的SARS冠状病毒-2(SARS-CoV-2)S-糖蛋白的受体结合结构域RBD1区域和RBD2区域的肽的结合进行预测(参考来源于武汉的分离物)。

7.根据权利要求6所述的方法，还包括用所述肽形成疫苗，其中显示出对目标群体内流行HLA的高亲和力的肽与理论或文献记载的中和抗体表位重叠。

8.一种用于产生包含任一项前述权利要求中的肽的个性化疫苗的方法，其中载体是用于在人体内表达的病毒载体或培养并随后用所述肽离体脉冲的内源性树突细胞。

9.一种用于产生包含任一项前述权利要求中的肽的个性化疫苗的方法，其中合适的载体是病毒样颗粒(VPL)。

10.一种用于产生包含任一项前述权利要求中的肽的个性化疫苗的方法，与疫苗佐剂如明矾和/或另一种类似佐剂一起施用。

11.一种用于产生包含任一项前述权利要求中的肽的个性化疫苗的方法，与金纳米颗粒联合施用。

12.一种用于产生包含任一项前述权利要求中的肽的个性化疫苗的方法，其中所述肽通过接头肽序列共价连接以形成多表位蛋白。

13.基于以下算法的个性化疫苗设计的网络工具或软件：A)输入个体/群体的核酸序列(HLA I、HLA II、目标病毒序列)；B)核酸翻译、序列比对、共有氨基酸序列构建；C)根据权利要求1-5中任一项的表位预测和评分。