[发明专利]一种TRPV3抑制剂的虚拟筛选方法、药物先导化合物及应用在审
| 申请号: | 202111669639.5 | 申请日: | 2021-12-31 |
| 公开(公告)号: | CN114373519A | 公开(公告)日: | 2022-04-19 |
| 发明(设计)人: | 谷陟欣;黄彪 | 申请(专利权)人: | 苏州佩德生物医药有限公司 |
| 主分类号: | G16C20/50 | 分类号: | G16C20/50;G16C20/64;G16C20/70 |
| 代理公司: | 武汉知产时代知识产权代理有限公司 42238 | 代理人: | 魏波 |
| 地址: | 215000 江苏省中国(江苏)自由贸易试*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 trpv3 抑制剂 虚拟 筛选 方法 药物 先导 化合物 应用 | ||
1.一种TRPV3抑制剂的虚拟筛选方法,其特征在于:包括如下步骤:
S1、从Protein data bank数据库中获取TRPV3共晶的三维结构,对其进行其进行加氢去水和氨基酸补缺处理得到结构优化的TRPV3;
S2、利用药物Dyclonine与TRPV3的结合位点Leu655、Ile674和Gly683设计对接盒子,进行分子对接程序,根据poses打分数值初步筛选出与TRPV3结合的化合物;
S3、基于配体的药效团模型,对步骤S2筛选的化合物进行筛选;
S4、对步骤S3筛选出的化合物进行活性筛选,获得具有TRPV3抑制活性的药物先导化合物。
2.如权利要求1所述的一种TRPV3抑制剂的虚拟筛选方法,其特征在于:步骤S1中,TRPV3为hTRPV3,所述hTRPV3的蛋白晶体结构的PDB格式文件为PDB ID:6MHO。
3.如权利要求2所述的一种TRPV3抑制剂的虚拟筛选方法,其特征在于:步骤S1中,采用Pymol软件对hTRPV3受体蛋白模型进行预处理,去除3个Domain保留1个Domain,然后进行加氢处理。
4.如权利要求1所述的一种TRPV3抑制剂的虚拟筛选方法,其特征在于:步骤S2中,进行分子对接程序时,选用的小分子化合物库包括DrugBank数据库。
5.如权利要求1所述的一种TRPV3抑制剂的虚拟筛选方法,其特征在于:步骤S3中,所述药效团模型包括氢键受体、氢键供体、疏水基团、π键和π-π堆积的中任一种或多种。
6.一种具有TRPV3抑制活性的药物先导化合物,采用如权利要求1-5任一项所述的方法得到,其特征在于:所述药物先导化合物为多肽,所述多肽与hTRPV3的结合位点包括Thr635、Ile637和Gly640。
7.如权利要求6所述的药物先导化合物,其特征在于:所述多肽为具有DPDPE的氨基酸序列及药学上可接受的衍生物。
8.一种如权利要求6所述的药物先导化合物在制备治疗皮肤病药物中的应用。
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