[发明专利]一种宏基因组血液样本绝对定量的产品、方法及其应用在审
申请号: | 202111520584.1 | 申请日: | 2021-12-10 |
公开(公告)号: | CN114242167A | 公开(公告)日: | 2022-03-25 |
发明(设计)人: | 曹德盼;纪丹丹;侯新华;李杜衡;贾雪峰 | 申请(专利权)人: | 天津金匙医学科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30;G16B30/00;G16B40/00;G16B50/30 |
代理公司: | 北京知汇林知识产权代理事务所(普通合伙) 11794 | 代理人: | 董涛 |
地址: | 301700 天津市武清区开发*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 宏基 血液 样本 绝对 定量 产品 方法 及其 应用 | ||
1.一种宏基因样本绝对定量的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
1)取宏基因组待检样本,加标签序列混合物后混匀,得混合样本;
2)混合样本DNA提取、建库和测序,获得下机数据;
3)分析下机数据中病原菌及标签序列的各自检出比例;
4)确立样本拟合线性关系,以每种标签序列检出比例为横坐标,对应标签的已知质量为纵坐标,拟合出样本线性关系公式:y=kx;
5)病原菌定量:根据样本拟合线性关系y=kx和病原菌检出比例x,计算对应病原菌的质量;定义质量和拷贝数换算公式,计算病原菌拷贝数;
所述拷贝数=6.02*10^23*10^(-9)*质量(ng)/(基因组长度bp*660g/mol)。
2.权利要求1所述的绝对定量的方法,其特征在于,所述标签序列混合物中包括选自SEQ ID NO.1-10中任一或多个标签;
优选的,所述标签序列个数为3个;
更优选的,所述标签序列如SEQ ID NO.1-3所示。
3.权利要求2所述的绝对定量的方法,其特征在于,所述标签序列混合物中SEQ IDNO.1、2、3标签浓度比为50-100:5-10:0.5-1;
优选的,所述SEQ ID NO.1、2、3标签浓度比为100:10:1。
4.权利要求1-3任一所述的绝对定量的方法,,其特征在于,所述标签序列混合物的制备方法为:将SEQ ID NO.1、2、3所示标签序列分别按照浓度比100:10:1配制混合物,分装30ul体系待用。
5.权利要求1-4任一所述的绝对定量的方法,其特征在于,所述样本为血液样本。
6.一种用于宏基因组血液样本绝对定量的标签序列,其特征在于,所述标签序列包括选自SEQ ID NO.1-10中任一或多个;
优选的,所述标签序列个数为3个;
更优选的,所述标签序列如SEQ ID NO.1-3所示。
7.权利要求6所述的标签序列,其特征在于,所述SEQ ID NO.1、2、3的浓度比为50-100:5-10:0.5-1;
优选的,所述SEQ ID NO.1、2、3标签浓度比为100:10:1。
8.一种用于宏基因组血液样本绝对定量的产品,其特征在于,所述产品包含权利要求6-7任一所述的标签序列。
9.权利要求8所述的产品,其特征在于,其特征在于,所述产品中标签SEQ ID NO.1、2、3的终浓度分别为0.0011ng/ul、0.00011ng/ul和0.000011ng/ul。
10.权利要求6-7任一所述的标签序列或权利要求7-8所述的产品的如下任一应用:
1)在血液样本感染检测中的应用;
2)在宏基因组血液样本绝对定量中的应用。
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