[发明专利]一种环状RNA的高效表达方法及表达载体在审
申请号: | 202111518785.8 | 申请日: | 2021-12-13 |
公开(公告)号: | CN114317602A | 公开(公告)日: | 2022-04-12 |
发明(设计)人: | 巫轲 | 申请(专利权)人: | 四川大学华西医院 |
主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85;C12N15/867;C12N15/113 |
代理公司: | 北京国坤专利代理事务所(普通合伙) 11491 | 代理人: | 王峰刚 |
地址: | 610041 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 环状 rna 高效 表达 方法 载体 | ||
1.一种环状RNA的高效表达方法,其特征在于,所述环状RNA的高效表达方法包括以下步骤:
步骤一,克隆环状RNA全长序列至pCRE5载体,命名为pCRE5-circRNA;
步骤二,将pCRE5-circRNA质粒瞬时转染至目标细胞或包装成慢病毒感染目标细胞,并分别对目标细胞进行RNA抽提和逆转录;
步骤三,环化引物设计及检测PCR体系构建。
2.如权利要求1所述环状RNA的高效表达方法,其特征在于,步骤一中,所述克隆环状RNA全长序列至pCRE5载体,包括:
(1)PCR扩增F-circSR1全长;
(2)使用Vazyme ClonExpressTM II One Step Cloning Kit将获取的片段与PCRE5载体进行重组连接,将F-circSR1克隆至环状RNA过表达区之间,命名为pCRE5-F-circSR1。
3.如权利要求2所述环状RNA的高效表达方法,其特征在于,步骤(1)中,所述PCR引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:1;
步骤(2)中,使用Phana酶为Phanta Max Super-Fidelity DNA Polymerase,50μL反应体系,PCR反应条件为:
PCR反应条件
4.如权利要求1所述环状RNA的高效表达方法,其特征在于,步骤一中,所述PCR产物回收扩增片段,全长1907bp。
5.如权利要求1所述环状RNA的高效表达方法,其特征在于,步骤二中,所述RNA抽提,包括:
(1)使用Lipo2000将pCRE5-F-circSR1质粒瞬时转染至H1299或A549或其他细胞,24h后收获RNA;
(2)提取F-circSR1过表达细胞RNA:在6孔板细胞中加入Trizol 1mL裂解细胞,充分混匀,室温静置5min;
(3)加200μL氯仿,充分混匀,室温静置3min,1200g 15min 4℃;
(4)取上清约500μL,加入500μL异丙醇,充分混匀,室温静置10min,12000g 10min 4℃;
(5)弃上清,留沉淀,加入1mL 75%的乙醇,混匀,7500g 5min 4℃;
(6)弃乙醇,晾干沉淀,加入DEPC水混匀,立即放冰上;
(7)用1μL RNA测浓度。
6.如权利要求1所述环状RNA的高效表达方法,其特征在于,步骤二中,所述逆转录,包括:
(1)10μL RNA,2μL Random Primer,85℃,3min;
(2)10*RT buffer 2μL,M-Mlv 1μL,inhibitor 1μL,RNase free water 4μL;
(3)65℃1.3h,80℃10min,store at-20℃。
7.如权利要求1所述环状RNA的高效表达方法,其特征在于,步骤三中,所述PCR引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:2。
8.如权利要求1所述环状RNA的高效表达方法,其特征在于,步骤三中,使用Phana酶为Phanta Max Super-Fidelity DNA Polymerase,50μL反应体系,
PCR反应条件为:
PCR反应条件
9.如权利要求1所述环状RNA的高效表达方法,其特征在于,步骤三中,1.5%琼脂糖胶电泳PCR片段长度675bp。
10.一种应用如权利要求1~9任意一项所述环状RNA的高效表达方法构建得到的环状RNA的高效表达载体,其特征在于,所述新型环状RNA表达载体中环状RNA的上游侧翼序列为SEQ ID NO:3,所述新型环状RNA表达载体环状RNA的下游侧翼序列为SEQ ID NO:4,所述新型环状RNA表达载体核心序列为SEQ ID NO:5。
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