[发明专利]一种基于光场显微系统的光场三维重建方法在审

专利信息
申请号: 202111066749.2 申请日: 2021-09-13
公开(公告)号: CN113850902A 公开(公告)日: 2021-12-28
发明(设计)人: 金欣;郑琦 申请(专利权)人: 清华大学深圳国际研究生院
主分类号: G06T17/00 分类号: G06T17/00;G06T7/557
代理公司: 深圳新创友知识产权代理有限公司 44223 代理人: 王震宇
地址: 518055 广东省深圳市*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 显微 系统 三维重建 方法
【权利要求书】:

1.一种基于光场显微系统的光场三维重建方法,其特征在于,包括如下步骤:

A1:搭建光场显微装置,按光的传播路径依次设置显微标本、显微镜、微透镜阵列、相机;

A2:根据需求确定移动间隔,设定相机帧率与平移台移动速度,确定相机端扫描策略;

A3:根据微透镜分布对光场图像进行平移、裁剪与对齐;

A4:根据荧光显微镜成像过程中散粒噪声特性,得到多光场图像三维重建目标函数;

A5:目标函数加入先验作为正则项,进行最大后验估计;

A6:将多光场反向投影平均结果作为迭代初始值;

A7:利用梯度下降算法进行迭代重建,得到大深度下分辨率深度一致的三维体。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤A1中,将所述微透镜阵列与所述相机进行固定,并将所述相机沿轴向放置在电控平移台上。

3.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,步骤A2中,确定相机端扫描策略为:

Dcam=M2Dsample

其中Dsample为物空间中深度方向上的采样间隔,优选取15-40μm,M为系统的放大倍数,Dcam为相机采样间隔距离。

4.如权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,步骤A2中,多图像采集过程中的采样间隔s、电控平移台移动速度v与相机帧率f满足:

v=sf。

5.如权利要求1至4任一项所述的方法,其特征在于,步骤A3中,对于分布均匀的微透镜阵列,根据连通域对单个微透镜进行划分得到中心微透镜与微透镜间距,以第一张光场图像作为基准对中心微透镜位置偏移量进行校准,并进行裁剪操作,使所有光场图像长宽一致并微透镜位置对齐。

6.如权利要求1至5任一项所述的方法,其特征在于,步骤A4中,利用似然函数的KL散度作为损失函数:

k为光场数据对应编号,k=1,2,…,N,共有N组,以k为下标代表不同组相对应的数据,H为系统的点扩散函数的矩阵表达式,f为实际采集到的光场显微图像,b为假设的散粒噪声,其服从泊松分布,g为需要求解的深度方向上分辨率深度一致性强的三维体。

7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤A5中,可加入的正则项包括L1、L2正则项与TV正则项,假设正则化项为f1(g),新的损失函数为:

L0=-∑kfkln(Hkg+b)+∑kfk!+∑k(Hkg+b)+λf1(g),

λ为正则项系数。

8.如权利要求1至7任一项所述的方法,其特征在于,步骤A7中,采用Richardson-Lucy算法,采用的梯度下降算法步长不固定,与前一次的迭代结果相关。

9.如权利要求6至7任一项所述的方法,其特征在于,步骤A7中,计算梯度:

根据梯度下降公式:

取有

通过将三维反卷积算法运用到采集到的多张光场图片中,最后得到分辨率深度一致性更佳的重建三维体。

10.一种计算机可读存储介质,存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序由处理器执行时,实现如权利要求1至9任一项所述的方法的步骤A2至A7。

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