[发明专利]面向DNA信息存储的编码和解码方法与装置有效

专利信息
申请号: 202110994739.9 申请日: 2021-08-27
公开(公告)号: CN113687976B 公开(公告)日: 2022-04-12
发明(设计)人: 李昊;陈河兵;孙昱;陈永强;王者;伯晓晨 申请(专利权)人: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
主分类号: G06F11/10 分类号: G06F11/10;G16B30/00
代理公司: 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 代理人: 何少岩
地址: 100082 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 面向 dna 信息 存储 编码 解码 方法 装置
【权利要求书】:

1.一种面向DNA信息存储的解码方法,其特征在于,所述方法包括:

对每个待解码目标子序列进行解码处理,得到多个第一中间子序列,其中,所述第一中间子序列包括原始子序列,以及插入至所述原始子序列中的指定位置的多个第一编码;所述第一编码包括所述原始子序列的原始地址编码和/或所述原始子序列的原始地址编码的原始冗余校验码;

针对每个所述第一中间子序列,对所述第一中间子序列中的每个所述第一编码进行校验处理,如果每个所述第一编码均校验正确,从所述第一中间子序列中提取得到原始子序列;

将校验正确的所述第一中间子序列的原始子序列进行排序,得到目标DNA序列;

所述对每个待解码目标子序列进行解码处理,得到多个第一中间子序列的步骤之前,还包括:

针对每个编码后的目标子序列,执行下述操作:

对编码后的目标子序列进行加扰偏移处理,得到第三中间子序列;

对所述第三中间子序列进行加躁采样与聚类匹配,得到第四中间子序列;

将所述第四中间子序列确定为所述待解码目标子序列。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述编码后的目标子序列进行加扰偏移处理,得到第三中间子序列的步骤包括:

对每个编码后的目标子序列进行加扰处理,得到第五中间子序列;对每个所述第五中间子序列进行数据偏移处理,得到第三中间子序列。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述第三中间子序列进行加躁采样与聚类匹配,得到第四中间子序列的步骤,包括:

对所述每个所述第三中间子序列进行指定次数的加躁采样,得到采样结果;

对所述采样结果进行聚类匹配,得到多个第四中间子序列。

4.一种面向DNA信息存储的解码装置,其特征在于,所述装置包括:

第一解码模块,用于:对每个待解码目标子序列进行解码处理,得到多个第一中间子序列,其中,所述第一中间子序列包括原始子序列,以及插入至所述原始子序列中的指定位置的多个第一编码;所述第一编码包括所述原始子序列的原始地址编码和/或所述原始子序列的原始地址编码的原始冗余校验码;

第二解码模块,用于:针对每个所述第一中间子序列,对所述第一中间子序列中的每个所述第一编码进行校验处理,如果每个所述第一编码均校验正确,从所述第一中间子序列中提取得到原始子序列;

排序模块,用于:将校验正确的所述第一中间子序列的原始子序列进行排序,得到目标DNA序列;

处理模块,用于针对每个编码后的目标子序列,执行下述操作:对编码后的目标子序列进行加扰偏移处理,得到第三中间子序列;对所述第三中间子序列进行加躁采样与聚类匹配,得到第四中间子序列;将所述第四中间子序列确定为所述待解码目标子序列。

5.一种电子设备,其特征在于,包括存储器和处理器,所述存储器中存储有可在所述处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行所述计算机程序时实现上述权利要求1至3任一项所述的方法的步骤。

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