[发明专利]水产动物疾病诊断与防治知识图谱构建方法

权利要求书

1.一种水产动物疾病诊断与防治知识图谱构建方法，其特征在于按照如下步骤进行：

步骤1.收集水产动物疾病诊断与防治相关的医学文本；

步骤2.将收集到的医学文本进行预处理；

步骤3.将经过预处理后的文本分为训练部分和应用部分，根据标注规则对训练部分文本进行人工标注，并进行模型训练；

所述标注规则如下：

（1）医学文本为如下6类实体时，则分别标注如下：

水产品名称，标注为B-NAM；

水产品病灶部位，标注为B-BOD；

水产品患病病原体，标注为B-PAT；

水产品患病临床表现，标注为B-SYM；

水产品患病名称，标注为B-DIS；

治疗疾病所需药品名称，标注为B-MED；

（2）医学文本为如下7类实体关系时，则分别标注如下：

水产品名称-水产品病灶部位-从属关系，标注为NAM-BOD-CS；

水产品名称-水产品患病病原体-病原关系，标注为NAM-PAT-BY；

水产品名称-水产品患病名称-患病关系，标注为NAM-DIS-HB；

水产品名称-治疗疾病所需药品名称-使用关系，标注为NAM-MED-SY；

水产品名称-水产品患病临床表现-症状关系，标注为NAM-SYM-ZZ；

水产品患病病原体-水产品患病名称-引起关系，标注为PAT-DIS-YQ；

水产品患病名称-治疗疾病所需药品名称-治疗关系，标注为DIS-MED-ZL；

（3）当水产品名称与患病名称嵌套时，将水产品名称标注为B-NAM，将患病名称标注为B-DIS；

（4）当水产品病灶部位与临床症状表现嵌套时，将病灶部位标注为NAM-BOD-CS、临床症状表现NAM-SYM-ZZ；

（5）当水产品病灶部位与形容词和患病临床表现嵌套时，将描述病灶部位形容词与病灶部位混合作为病灶部位进行标注，标注为NAM-BOD-CS，患病临床表现标注为NAM-SYM-ZZ；

（6）当患病病原体与病原体身体部位嵌套时，只标注患病病原体，标注为NAM-PAT-BY；

（7）当患病病原体与大量寄生嵌套时，将患病病原体与大量寄生作为整体进行标注，标注为NAM-PAT-BY；

（8）当出现死亡一词时，不作为临床症状进行标注；

步骤4.用训练好的模型对应用部分文本进行实体的识别和实体关系的抽取，分别得到实体和实体关系的标签序列，具体如下：

步骤4.1采用BERT的词嵌入方法，将文本序列变成机器可识别的向量矩阵；

步骤4.2将获得的向量矩阵送入BiLSTM+CRF中进行特征提取和标签预测；

步骤4.3将提取到的特征矩阵进行特征整合，获得整合特征矩阵；

步骤4.4将整合特征矩阵计入Attention，得到添加Attention的整合特征矩阵；

步骤4.5将添加Attention的整合特征矩阵送入下一层BiLSTM+CRF中进行特征提取和标签预测，分别得到实体和实体关系的标签序列；

步骤5. 将得到的实体和实体关系的标签序列进行知识融合，并将融合后的实体和实体关系的标签序列送入Neo4j图数据库中，形成水产动物疾病诊断与防治的医学知识图谱。