[发明专利]肝癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备在审

专利信息
申请号: 202110725176.3 申请日: 2021-06-29
公开(公告)号: CN113345589A 公开(公告)日: 2021-09-03
发明(设计)人: 杨承刚;宋宏涛;董东 申请(专利权)人: 北京泱深生物信息技术有限公司
主分类号: G16H50/30 分类号: G16H50/30;G16B20/20
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 100176 北京市大兴区*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 肝癌 预后 模型 构建 方法 应用 电子设备
【说明书】:

发明提供了一种肝癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备。该构建方法包括:获取多个肝癌患者和多个参考人的转录谱表达数据;基于上述转录谱表达数据,筛选候选基因;以及,基于候选基因,构建风险评分模型。肝癌预后模型包括风险评分模型。

技术领域

本公开的实施例涉及一种肝癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备及存储介质。

背景技术

预后是指根据经验预测的疾病发展情况。预后主要涉及到三个方面,将发生什么结果、发生不良结果的可能性以及时间点。研究和评级预后的目的,在于便于了解疾病对人类危害性的大小、探索影响预后的因素、研究改善预后的具体措施。预后分析是临床非常实用、对临床很有指导作用的临床研究。

肝脏是维持机体内环境稳定和机体健康的最重要的器官之一,脂肪肝、肝炎、肝硬化和肝癌是肝内最常见的四大严重疾病,也是危害人类健康的重要原因之一。事实上,每年大约有一百万人死于肝硬化和肝癌。特别需要指出的是,作为肝脏最常见的原发恶性肿瘤一肝癌因为发病率较高、发现困难、治疗方法少等原因已经在导致人类死亡的各种疾病中位居前列。目前,肝癌在全球范围内肿瘤致死率方面位列第五位,而在一些非洲和亚洲国家,肝癌在肿瘤性死因中已经位居首位。

经过几十年的努力,肝癌研究已取得很大进展,上世纪以“小肝癌的早治”及“肝癌的缩小后二期切除”为标志,分别为肝癌术后生存率的提高贡献了10个百分点,但由于肝癌病程进展速度快,有极高的复发率,致使肝癌总体疗效仍然不佳,肝癌人群总体5年生存率仍只有5%左右。近年,虽然在肝癌基础与临床研究方面取得了一些进展,但还未能明确阐明肝癌复发的机制,也未能找到有效的干预措施。肝癌高复发成为影响其疗效改善的瓶颈。

生物标志物是一种能客观测量并评价正常生物过程、病理过程或对药物干预反应的指示物,也是生物体受到损害时的重要预警指标,涉及细胞分子结构和功能的变化,生化代谢过程的变化,生理活动的异常表现,个体、群体或整个生态系统的异常变化等。生物标志物的研究不仅是生物化学基础研究的重要内容,同时在新药开发、医学诊断、临床研究方面具有重要的价值,有助于帮助研究人员提出更有效的诊疗手段,尤其在肿瘤、心血管疾病、糖尿病、神经性失调等慢性疾病与复杂疾病的防控上具有重要的价值。因此,寻找与肝癌预后复发相关的生物标志物,可以为进一步降低临床肝癌复发率和病死率提供新的方法。

发明内容

本发明提供了一种肝癌预后模型的构建方法,所述构建方法包括:

获取多个肝癌患者和多个参考人的转录谱表达数据;

基于所述多个肺癌患者和所述多个参考人的转录谱表达数据,筛选候选基因;以及

基于所述候选基因,构建风险评分模型;

其中,所述肺癌预后模型包括所述风险评分模型。

进一步,基于所述候选基因,构建风险评分模型,包括:

获取训练数据集;

在所述训练数据集中,基于所述候选基因,通过单因素Cox回归分析,确定与生存期相关的基因;以及

通过LASSO Cox回归分析对所述与生存期相关的基因进行筛选,以确定用于构建所述风险评分模型的基因以及所述风险评分模型,其中,用于构建所述风险评分模型的基因包括DUSP5、PSME3、RHEB。

进一步,所述风险评分模型表示为:风险评分=0.11083689*DUSP5基因表达水平+0.28532904*PSME3基因表达水平+0.45426836*RHEB基因表达水平。

进一步,基于所述候选基因,构建所述风险评分模型,还包括:基于所述训练数据集,评估所述风险评分模型的预测性能。

进一步,基于所述训练数据集,评估所述风险评分模型的预测性能,包括:

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