[发明专利]肝癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备在审
| 申请号： | 202110725176.3 | 申请日： | 2021-06-29 |
| 公开（公告）号： | CN113345589A | 公开（公告）日： | 2021-09-03 |
| 发明（设计）人： | 杨承刚;宋宏涛;董东 | 申请（专利权）人： | 北京泱深生物信息技术有限公司 |
| 主分类号： | G16H50/30 | 分类号： | G16H50/30;G16B20/20 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 100176 北京市大兴区*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 肝癌 预后 模型 构建 方法 应用 电子设备 | ||
1.一种肝癌预后模型的构建方法，其特征在于，所述构建方法包括：
获取多个肝癌患者和多个参考人的转录谱表达数据；
基于所述多个肺癌患者和所述多个参考人的转录谱表达数据，筛选候选基因；以及
基于所述候选基因，构建风险评分模型；
所述肺癌预后模型包括所述风险评分模型；
基于所述候选基因，构建风险评分模型，包括：
获取训练数据集；
在所述训练数据集中，基于所述候选基因，通过单因素Cox回归分析，确定与生存期相关的基因；以及
通过LASSOCox回归分析对所述与生存期相关的基因进行筛选，以确定用于构建所述风险评分模型的基因以及所述风险评分模型，其中，用于构建所述风险评分模型的基因包括DUSP5、PSME3、RHEB。
2.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述风险评分模型表示为：风险评分＝0.11083689*DUSP5基因表达水平+0.28532904*PSME3基因表达水平+0.45426836*RHEB基因表达水平。
3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，基于所述候选基因，构建所述风险评分模型，还包括：
基于所述训练数据集，评估所述风险评分模型的预测性能。
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，基于所述训练数据集，评估所述风险评分模型的预测性能，包括：
基于所述风险评分模型计算所述训练数据集中的每个肝癌患者的风险评分；
使用所述训练数据集的时间依赖的肝癌患者工作特征曲线分析评估风险评分模型的拟合优度；
依据所述训练数据集的时间依赖的肝癌患者工作特征曲线分析确定分组截断值，并根据所述分组截断值将所述训练数据集中的肝癌患者分为第一高风险组与第一低风险组；以及
使用所述训练数据集的Kaplan-Meier曲线评估所述第一高风险组与所述第一低风险组在生存情况方面是否具有显著差异。
5.根据权利要4所述的构建方法，其特征在于，基于所述候选基因，构建所述风险评分模型，还包括：
获取验证数据集；以及
基于所述验证数据集，验证所述风险评分模型的效能。
6.根据权利要求5所述的构建方法，其特征在于，基于所述验证数据集，验证所述风险评分模型的效能，包括：
基于所述风险评分模型计算所述验证数据集中的每个肝癌患者的风险评分；
使用所述验证数据集的时间依赖的肝癌患者工作特征曲线分析验证风险评分模型的拟合优度；以及
根据所述分组截断值将所述验证数据集中的肝癌患者分为第二高风险组与第二低风险组，并使用所述验证数据集的Kaplan-Meier曲线验证所述第二高风险组与所述第二低风险组在生存情况方面是否具有显著差异。
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