[发明专利]人工核酸序列水印编码系统、水印字符串及编码和解码方法有效

专利信息
申请号: 202110716040.6 申请日: 2021-06-25
公开(公告)号: CN113380322B 公开(公告)日: 2023-10-24
发明(设计)人: 康康;陈钰 申请(专利权)人: 倍生生物科技(深圳)有限公司
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30;G16B25/10;G06F21/60
代理公司: 深圳市能闻知识产权代理事务所(普通合伙) 44717 代理人: 赖银杰
地址: 518000 广东省深圳市宝*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 人工 核酸 序列 水印 编码 系统 字符串 解码 方法
【权利要求书】:

1.一种人工核酸序列水印编码系统,其特征在于,包括:

可变编码段,以及至少一个与所述可变编码段连接的水印字符串;其中,所述可变编码段设于所述人工核酸序列水印编码系统中的中游位置,所述水印字符串设于所述人工核酸序列水印编码系统中的上游位置和/或下游位置;

所述可变编码段包括至少一个信息单元;

所述信息单元包括一核酸特征部,以及与所述核酸特征部连接且与所述核酸特征部对应的编号部。

2.如权利要求1所述人工核酸序列水印编码系统,其特征在于,

所述水印字符串长度不小于3;

在所述可变编码段中,多个所述信息单元按5′到3′顺序排列,用于表示人工核酸片段上的功能片段种类和对应编号。

3.如权利要求1所述人工核酸序列水印编码系统,其特征在于,

每个所述信息单元中的所述核酸特征部用于表示DNA组装方法和接口信息、筛选标记信息、复制起始点信息、报告基因信息、插入片段骨架种类信息、插入片段启动子信息、插入片段RBS信息,以及插入片段CDS信息或插入片段终止子信息。

4.如权利要求1所述人工核酸序列水印编码系统,其特征在于,

还包括使用场景段,用于表示所述人工核酸序列水印编码系统的结束和使用场景;

所述使用场景段与所述可变编码段连接;

所述使用场景段设于所述人工核酸序列水印编码系统中的上游位置或下游位置;

所述可变编码段设于所述使用场景和/或所述水印字符串之间的中游位置。

5.如权利要求4所述人工核酸序列水印编码系统,其特征在于,

所述使用场景段包括用于标识使用场景的细菌人工染色体标识、酵母人工染色体标识、核基因组标识、线粒体基因组标识和/或叶绿体基因组标识RNA片段标识。

6.一种如权利要求1-5任一项所述人工核酸序列水印编码系统中的水印字符串,其特征在于,

所述人工核酸序列水印编码系统中的水印字符串,其长度不小于15bp/nt;并且,所述水印字符串能作为通用PCR引物序列,对人工核酸片段扩增和测序。

7.如权利要求6所述人工核酸序列水印编码系统中的水印字符串,其特征在于,

所述水印字符串,其核酸序列、核酸序列的反向互补序列、RNA序列和/或RNA序列的反向互补序列的序列本身和/或其子序列,为如下核酸序列、核酸序列的反向互补序列、RNA序列和RNA序列的反向互补序列的相似度不小于95%的序列;其中,

核酸序列为:

GAACGCCGGCTTGTATGTCGGTATGCGGGCTCGGTT;

核酸序列的反向互补序列为:

AACCGAGCCCGCATACCGACATACAAGCCGGCGTTC;

RNA序列为:

GAACGCCGGCUUGUAUGUCGGUAUGCGGGCUCGGUU;

RNA序列的反向互补序列为:

AACCGAGCCCGCAUACCGACAUACAAGCCGGCGUUC。

8.一种人工核酸序列水印编码系统的编码和解码方法,其特征在于,包括:

编码方法:

预设水印字符串、可变编码段和使用场景段;

将所述水印字符串、所述可变编码段和所述使用场景段进行编码,获得目标人工核酸序列;

解码方法:

对目标人工核酸序列进行Sanger测序,获取测序结果;

由所述测序结果,获取其中上游位置、中游位置和下游位置的水印字符串、可变编码段和使用场景段对应的核酸序列;

对所述水印字符串、所述可变编码段和所述使用场景段对应的核酸序列进行信息解读转换,获得解码信息。

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