[发明专利]一种基于膜吸附的黄瓜基因DNA快速提取扩增方法在审

专利信息
申请号: 202110691423.2 申请日: 2021-06-22
公开(公告)号: CN113528505A 公开(公告)日: 2021-10-22
发明(设计)人: 薛强;陈艳;邹明强 申请(专利权)人: 中国检验检疫科学研究院;中检国研(北京)科技有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/686;C12Q1/6806
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地址: 100176 北京市*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 吸附 黄瓜 基因 dna 快速 提取 扩增 方法
【说明书】:

发明公开了一种基于膜吸附的黄瓜基因DNA快速提取扩增方法,所述提取扩增方法包括以下步骤:(1)黄瓜果实的切碎与裂解;(2)滤膜片的制备与基因DNA吸附;(3)滤膜片的清洗;(4)滤膜片吸附DNA在PCR反应液中的洗脱;(5)PCR扩增与产物电泳。本方法可以从黄瓜的表皮、表层果肉和中心果肉中稳定提取基因DNA进行扩增,操作简单,成本低,提取快速,可以在10分钟内提取适用于扩增的黄瓜基因DNA,适用于黄瓜基因的快速鉴定与分析。

技术领域

本发明涉及黄瓜基因DNA提取扩增技术领域,特别是涉及一种黄瓜基因DNA快速提取扩增方法。

背景技术

黄瓜是遍布世界的重要蔬菜,黄瓜基因组计划已经完成,各种基因组学研究方法正在如火如荼展开,特别是对黄瓜基因组的改造,在抗病性、抗虫害、抗逆性、抗除草剂、品质改良等方面进行了许多研究,得到了多种性状优良的品种,但是为了更好地品种确证,对黄瓜特定基因的鉴定与分析是常用的实验方法。

在黄瓜特定基因的鉴定与分析中,首先提取黄瓜基因DNA。目前常用的提取方法是CTAB法和SDS法,一般以新鲜叶片为原材料,需要研磨等步骤,较为费时费力,而且在市场上销售的黄瓜也很难找到叶片。商品化试剂盒多采用二氧化硅吸附离心法与磁珠吸附法。在二氧化硅吸附离心法中,在高浓度超离液盐(chaotropic salt)存在的情况下核酸与固体二氧化硅支撑物结合,然后通过一系列清洗和离心步骤去除杂质,最后在低浓度盐溶液中从二氧化硅洗脱核酸。而磁珠吸附法是在磁珠表面进行官能团修饰,实现与核酸结合,然后利用磁铁吸附磁珠来进行分离和清洗杂质,然后将磁珠上的核酸洗脱。

滤膜(cellulose membrane)吸附法也可以用于核酸的提取,修饰后的滤膜可以从人血液里提取基因组DNA,也可以在多种生物体里实现核酸快速提取,还可以用于法医中DNA证物的长期保存。膜吸附法操作简便,不需要离心机、磁铁等辅助设备,具有很大的应用潜力。

发明内容

本发明的目的是提供一种基于膜吸附的黄瓜基因DNA快速提取扩增方法。

本发明采用的黄瓜基因DNA快速提取扩增方法原理如图1所示,取黄瓜果实表皮、表层果肉或者中心果肉10-100mg,放入小管中,用镊子捏碎,直至无明显大块果实,加入100μL裂解液,充分混匀,室温孵育1分钟。放入制备好的滤膜片,室温作用1分钟;将滤膜片取出后放入盛有清洗液的小管进行清洗,室温作用1分钟;将滤膜片取出放入配制好的PCR反应液中,室温孵育1分钟,去除滤膜片,进行核酸扩增,扩增后产物进行琼脂糖凝胶电泳分析。

为实现上述目的,本发明采用的技术方案具体如下:

基于膜吸附的黄瓜基因DNA快速提取扩增方法,包括以下步骤:

(1)黄瓜果实的切碎与裂解;

(2)滤膜片的制备与基因DNA吸附;

(3)滤膜片的清洗;

(4)滤膜片吸附DNA在PCR反应液中的洗脱;

(5)PCR扩增与产物电泳。

其中,所述黄瓜果实的切碎与裂解是取黄瓜果实表皮、表层果肉或者中心果肉10-100mg,放入小管中,用镊子捏碎,直至无明显大块果实,加入100μL裂解液,充分混匀,室温孵育1分钟。

其中,所述黄瓜果实裂解过程中使用的裂解液配制步骤如下:如配制1L裂解液,依次加入100mL 8M盐酸胍(终浓度:800mM),100mL 500mM Tris[pH 8](终浓度:50mM),0.5mLTriton X100,1mL Tween-20,用纯净水定容到1L。

其中,所述滤膜片的制备如下,选择符合如下特征的滤膜:纤维素含量≥98%,孔径≈10μm,厚度≈200μm,过滤速度≈150s。将滤膜片裁剪成2-3mm直径的圆片。,裁剪为2-3mm直径的圆片,置于干燥处。

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