[发明专利]一种预测肿瘤炎性小体活性状态及治疗敏感性的基因集系统及方法在审
申请号: | 202110689083.X | 申请日: | 2021-06-22 |
公开(公告)号: | CN113707223A | 公开(公告)日: | 2021-11-26 |
发明(设计)人: | 梁庆昱;吴建奇;程文;吴安华 | 申请(专利权)人: | 吴安华 |
主分类号: | G16B25/10 | 分类号: | G16B25/10;G16B35/20;G16B40/30;G16B5/00 |
代理公司: | 大连星海专利事务所有限公司 21208 | 代理人: | 郭海英 |
地址: | 110001 辽宁省沈阳市南京*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 预测 肿瘤 小体 活性 状态 治疗 敏感性 基因 系统 方法 | ||
1.一种预测肿瘤炎性小体活性状态及治疗敏感性的基因集,其特征在于,所述基因集为炎性小体活性相关基因集IRGs,炎性小体活性相关基因集IRGs包含15个炎症小体核心基因、34个CASP1调控基因、92个IL1B调控基因、8个IL18调节基因、13个GSDMD调节基因五个基因集;
所述15个炎症小体核心基因包含NLRP1、NLRP3、CASP4、CASP5、NLRC5、NLRP6、NLRP12、NLRP7、NAIP、NLRC4、AIM2、IFI16、MEFV、NLRP2和PYCARD十五个基因;
所述34个CASP1调控基因包含TMEM260、TIFA、LSM4、CERS2、PLCG2、FAM219A、LAMTOR3、KLF11、CTSH、CAPZA2、ACTL6A、C10orf11、KLRB1、UBR1、PPP1R12B、ZNF512B、FARP2、PPIP5K1、PHKA1、BACE1、MRPS27、TRAPPC12、TAS1R3、CD247、CYBRD1、PCED1A、AP5M1、RMDN1、FBXO31、BLOC1S6、ATP10D、FMO1、FKBP5和NNT三十四个基因;
所述92个IL1B调控基因包含ADAM17、SLC11A2、EREG、CSF1、ESR1、BID、BACH1、TNFRSF1B、MAPKAPK3、IFNAR2、NFKB2、OSMR、BTN1A1、IRF5、GNAQ、SULF2、SLC7A11、SLAMF1、SELP、NPY1R、PROKR1、SOD2、SERPINB2、RAB32、PTGER4、STX11、IGSF3、ARHGAP27、TBC1D9、TNIP1、SLAMF8、ACTR3B、PIM1、MAP3K8、POLR3K、BCL3、HOXD13、CDCA2、RND1、CERS5、GPR171、PTGS2、NFATC2、B3GAT1、CH25H、IL33、SLC5A1、NFKBIE、SOCS3、ELF3、SELE、TNFAIP2、TLR2、CHL1、CCL2、STEAP4、ZC3H12A、IL6、VCAM1、NFKBIZ、CXCL1、CCL20、LACC1、ZNF608、GBP6、LIM2、HS3ST2、COX5B、PDE4B、ASCL2、EHD2、SCN3A、SC5D、DYNC2H1、BCL9L、ALG9、TMEM25、NXPE4、IFT46和RNF214九十二个基因;
所述8个IL18调节基因包含CD226、KLRB1、CXCR6、THY1、SAMD3、TXK、C5orf28、FASLG、RGS11、CTSW、MID1、CAMK2B和CNBD2八个基因;
所述13个GSDMD调节基因包含NLRP1、NLRP3、CASP4、CASP5、NLRC5、NLRP6、NLRP12、NLRP7、NAIP、NLRC4、AIM2、IFI16、MEFV、NLRP2和PYCARD八个基因。
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