[发明专利]一种基于铁死亡水平评价胶质母细胞瘤患者免疫治疗反应性的系统及分析方法

权利要求书

1.一种基于铁死亡水平评价胶质母细胞瘤患者免疫治疗反应性的系统，它包括输入模块、分析模块和输出模块，其特征在于，

所述输入模块用于输入待测样本的转录组测序数据；

所述分析模块以待测样本的铁死亡特征性基因集的基因表达数据为输入，采用ssGSEA算法计算待测样本的铁死亡评分，并将待测样本的铁死亡评分与对照值进行比较，以大于或小于对照值确定待测样本的免疫治疗反应性和是否具有免疫抑制性微环境；

所述输出模块用于输出待测样本的免疫治疗反应性和是否具有免疫抑制性微环境的结果；

所述铁死亡特征性基因集包含ACSL1、ACSL3、ACSL4、ACSL5、ACSL6、ALOX15、ATG5、ATG7、CP、CYBB、FTH1、FTL、FTMT、GCLC、GCLM、GPX4、GSS、HMOX1、LPCAT3、MAP1LC3A、MAP1LC3B、MAP1LC3C、NCOA4、PCBP1、PCBP2、PRNP、SAT1、SAT2、SLC11A2、SLC39A14、SLC39A8、SLC3A2、SLC40A1、SLC7A11、STEAP3、TF、TFRC、TP53、VDAC2和VDAC3。

2.一种基于铁死亡水平评价胶质母细胞瘤患者免疫治疗反应性的分析方法，其特征在于，包含以下步骤：

e）收集胶质母细胞瘤患者的组织样本，对组织块进行转录组测序；

f）输入转录组测序数据，通过ssGSEA算法基于铁死亡特征性基因集计算胶质母细胞瘤患者的铁死亡评分；

g）将步骤f得到的胶质母细胞瘤患者的铁死亡评分与对照值进行比较，如果高于对照值，确定该胶质母细胞瘤患者具有免疫抑制性微环境，对免疫调控点靶向治疗反应性差，如果低于对照值，确定该胶质母细胞瘤患者的免疫微环境为激活状态，对免疫调控点靶向治疗敏感；

所述铁死亡特征性基因集包含ACSL1、ACSL3、ACSL4、ACSL5、ACSL6、ALOX15、ATG5、ATG7、CP、CYBB、FTH1、FTL、FTMT、GCLC、GCLM、GPX4、GSS、HMOX1、LPCAT3、MAP1LC3A、MAP1LC3B、MAP1LC3C、NCOA4、PCBP1、PCBP2、PRNP、SAT1、SAT2、SLC11A2、SLC39A14、SLC39A8、SLC3A2、SLC40A1、SLC7A11、STEAP3、TF、TFRC、TP53、VDAC2和VDAC3。

3.根据权利要求1所述的一种基于铁死亡水平评价胶质母细胞瘤患者免疫治疗反应性的系统或根据要求2所述的一种基于铁死亡水平评价胶质母细胞瘤患者免疫治疗反应性的分析方法，其特征在于，所述对照值采用以下步骤确定：

a）获取样本数据集，以CGGA、TCGA、GSE6011和Rembrandt四个胶质瘤数据库的1750例数据作为样本数据集，所述1750例数据包含每例样本的基因表达数据；

b）计算铁死亡评分，以样本数据集的铁死亡特征性基因集的基因表达数据为输入，用ssGSEA算法计算步骤a中每例样本的铁死亡评分；

c）确定对照值，计算步骤b中所有胶质母细胞瘤患者铁死亡评分的中位值作为对照值。