[发明专利]一种密码子优化的沙眼衣原体ctl0286基因及其应用有效

专利信息
申请号: 202110591839.7 申请日: 2021-05-28
公开(公告)号: CN113373163B 公开(公告)日: 2022-06-03
发明(设计)人: 包小峰;陆春风;孙邈;刘书龙;谢文霞;姜和 申请(专利权)人: 南通大学
主分类号: C12N15/31 分类号: C12N15/31;C12N15/70;C07K14/295;C07K16/12;C07K16/06;G01N33/569;A61K38/16;A61P27/02;C12R1/19
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 黄欣
地址: 226019 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 密码子 优化 沙眼 衣原体 ctl0286 基因 及其 应用
【说明书】:

发明公开了一种密码子优化的沙眼衣原体ctl0286基因及其应用,属于生物医药技术领域。所述密码子优化的沙眼衣原体ctl0286基因,其序列如SEQ ID NO.1所示。本发明通过密码子优化策略,实现了大肠杆菌系统中不能表达的沙眼衣原体蛋白CTL0286的体外表达,使用表达蛋白制备的抗体可用于CTL0286蛋白的鉴定;作为沙眼衣原体中未知功能的特有蛋白,本发明可为CTL0286蛋白的功能研究和抗体开发提供基础,进而为临床衣原体治疗和鉴定提供新靶点和药物。

技术领域

本发明属于生物医药技术领域,具体涉及一种密码子优化的沙眼衣原体ctl0286基因及其应用。

背景技术

众所周知,基因转录离不开RNA聚合酶的参与,衣原体RNA聚合酶(cRNAP)核心酶中的α、β、β′亚基的同源物均已找到,但直到目前为止,衣原体中是否存在ω因子的功能类似物仍未能得到证实。

衣原体启动子体外转录活性的测定,经常借用大肠杆菌RNA聚合酶(eRNAP)来模拟cRNAP,由此发明人推测衣原体中假如存在ω因子功能类似物的话,那么它与eRNAP的ω因子的同源性应该是相对较高的。

发明人从E.coli K-12菌株MG1655的ω蛋白序列出发,经多步骤Blast搜索Chlamydiae(taxid:204428)数据库,最终发现了沙眼衣原体L2(Ct L2)中潜在的ω因子功能类似物CTL0286。CTL0286是一个迄今为止仍未被研究过的衣原体蛋白,在研究该蛋白的功能之前,需要体外表达得到这个蛋白。

由于ctl0286基因中含有9个E.coli中的aga精氨酸稀有密码子(占ctl0286密码子总数的9%),导致其蛋白不能在E.coli系统中表达。为此,发明人尝试对ctl0286基因的密码子进行全面优化,构建E.coli中的表达质粒并成功诱导表达CTL0286蛋白。

发明内容

本发明的目的是提供一种密码子优化的沙眼衣原体ctl0286基因,该ctl0286基因可成功表达CTL0286蛋白,同时,CTL0286蛋白作为衣原体特有的蛋白,后续针对该蛋白的抗体研究可为临床衣原体鉴定提供新思路。

为了实现上述发明目的,本发明采用以下技术方案:

一种密码子优化的沙眼衣原体ctl0286基因,其序列如SEQ ID NO.1所示。

一种表达载体,包含上述沙眼衣原体ctl0286基因。

进一步地,所述表达载体为pET28a载体或者pET21c载体。

一种沙眼衣原体CTL0286蛋白的表达方法,包括如下步骤:

(1)合成上述沙眼衣原体ctl0286基因;

(2)构建含有所述沙眼衣原体ctl0286基因的表达载体:

具体地,将所述沙眼衣原体ctl0286基因连接至pET28a载体或者pET21c载体的NdeI/XhoI位点,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,在相应抗性的LB平板上进行抗性筛选,经PCR鉴定,即可得到表达载体;

(3)将所述表达载体转化宿主细胞、表达:

具体地,将重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3)化学感受态细胞,涂布于相应抗性的LB平板上培养,挑取平板中生长良好的菌落接种于含有相应抗生素的LB液体培养基中培养,然后将培养的菌液接种至不含抗生素的LB液体培养基中,培养至OD600=0.6-0.8,加入终浓度为1mM的IPTG,继续振摇培养。

本发明通过对ctl0286基因密码子的全面优化,可以高表达地获得CTL0286蛋白,可实现CTL0286蛋白功能的研究,也可用于CTL0286抗体的制备。

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