[发明专利]一种筛选用于二倍体群体亲子鉴定的分子标记组合的方法有效

专利信息
申请号: 202110514979.4 申请日: 2021-05-11
公开(公告)号: CN113096734B 公开(公告)日: 2021-12-14
发明(设计)人: 夏晓勤;夏雷;石米娟;张婉婷;程莹寅 申请(专利权)人: 中国科学院水生生物研究所
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B20/20;G16B40/00
代理公司: 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 代理人: 江丽丽
地址: 430072 *** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 一种 筛选 用于 二倍体 群体 亲子鉴定 分子 标记 组合 方法
【权利要求书】:

1.一种筛选用于亲子鉴定的分子标记组合的方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1. 将亲本按照一个父本、一个母本构建亲本对,所有候选的亲本对组合作为树状结构的根节点,以表示所有待区分的亲本对集合,以根节点作为第一层级的分支节点开始筛选第一个标记;

S2. 从树状结构的某一层级中筛选一个亲子鉴定分子标记的方法为:对于每一个候选分子标记,先依据亲本分型对同一层级每个分支节点中的子代分型进行预估,再根据子代分型的情况,用分型相同的子代对应的亲本对构建该分支节点在树状结构的下一层级的一个子节点,从而可由不同分型的子代得到多个子节点;在下一层级中,去掉叶子节点和重复的子节点后,统计各子节点所含亲本对数量并计算其均值和方差,以均值与方差之和来评价该标记的分型效果,从所有候选标记中,选择均值与方差之和最小的分子标记作为该层级的亲子鉴定分子标记;

S3. 获取上述筛选到的分子标记所产生的子节点,剔除其中的叶子节点和重复的子节点后,剩余节点作为父节点构建下一层树状结构的子节点,按照步骤S2进行下个标记的筛选,直至无新的分支节点产生;

S4. 总结上述S2和S3中筛选到的分子标记,这些标记组合即为一套亲子鉴定标记。

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