[发明专利]数据预筛方法及其数据预筛装置在审
申请号: | 202110495855.6 | 申请日: | 2021-05-07 |
公开(公告)号: | CN115312123A | 公开(公告)日: | 2022-11-08 |
发明(设计)人: | 谢明哲;杨杰胜 | 申请(专利权)人: | 台达电子工业股份有限公司 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B5/00;G16B25/20;G06F17/13 |
代理公司: | 隆天知识产权代理有限公司 72003 | 代理人: | 李琛;黄艳 |
地址: | 中国台*** | 国省代码: | 台湾;71 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 数据 方法 及其 装置 | ||
一种数据预筛方法,适用于具有复数个数据点的一扩增曲线,包含:计算相对应于该些数据点的复数个一阶导数值;从该些一阶导数值中搜索至少一局部最大值;判断与该至少一局部最大值相邻的部分一阶导数值是否均为正值;根据判断结果,决定该至少一局部最大值或者位于一预设循环数之后的其中一个一阶导数值为一目标最大值;根据与该目标最大值相对应的一目标循环数推算一基准循环数;以及根据该基准循环数设定该扩增曲线的一基准线,以根据调整过的该扩增曲线计算出一第一Cq值。本公开更提供一种用于执行数据预筛方法的数据预筛装置。
技术领域
本公开内容涉及一种数据预筛方法及其数据预筛装置,特别涉及一种适用于聚合酶连锁反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)的扩增曲线的数据预筛方法及其数据预筛装置。
背景技术
在进行核酸检测时,一般会监测聚合酶连锁反应过程中每个循环数所产生的荧光信号。基于每个循环数所产生的荧光信号所绘制成的曲线通常可称为扩增曲线。传统上,常常通过扩增曲线计算Cq值(代表荧光信号到达预设的一门限值所需的循环数),以进行阳性或阴性的判读。然而,荧光信号的不稳定常常会影响Cq值的计算,进而影响核酸检测的判读结果。
发明内容
本公开内容的一实施方式为一数据预筛方法。该数据预筛方法适用于一处理器,其中该处理器耦接于存储有一扩增曲线的一存储器,该扩增曲线是通过对一待测物进行聚合酶连锁反应而产生的,该扩增曲线包含复数个数据点,该数据预筛方法包含:计算相对应于该些数据点的复数个一阶导数值;从该些一阶导数值中搜索至少一局部最大值;判断该至少一局部最大值是否大于一第一阈值,并判断与该至少一局部最大值相邻的部分一阶导数值是否均为正值;根据判断结果,决定该至少一局部最大值或者位于一预设有效循环数之后的其中一个一阶导数值为一目标最大值;取得与该目标最大值相对应的一目标循环数;根据与该目标循环数相对应的一阶导数值推算一基准循环数;根据该基准循环数调整该些数据点,以形成该扩增曲线的一基准线;以及根据调整后的该扩增曲线计算出一第一Cq值。
本公开内容的另一实施方式为一数据预筛装置。该数据预筛装置包含一存储器以及一处理器。该存储器用以存储具有复数个数据点的一扩增曲线,其中该扩增曲线是通过对一待测物进行聚合酶连锁反应而产生的。该处理器耦接该存储器,用以执行以下步骤:计算相对应于该些数据点的复数个一阶导数值;从该些一阶导数值中搜索至少一局部最大值;判断该至少一局部最大值是否大于一第一阈值,并判断与该至少一局部最大值相邻的部分一阶导数值是否均为正值;根据判断结果,决定该至少一局部最大值或者位于一预设有效循环数之后的其中一个一阶导数值为一目标最大值;取得与该目标最大值相对应的一目标循环数;根据与该目标循环数相对应的一阶导数值推算一基准循环数;根据该基准循环数调整该些数据点,以形成该扩增曲线的一基准线;以及根据调整后的该扩增曲线计算出一第一Cq值。
综上,本公开的数据预筛装置与数据预筛方法在计算Cq值之前,先根据典型或非典型扩增曲线的特征(例如,反曲点或于较后面的循环数递增的一阶导数值)来找出有意义的数据,以降低因为荧光信号不稳定而造成的计算偏差。此外,在计算出Cq值之后,本公开还可通过调整第一阈值或第二阈值来重新计算Cq值,进而验证前次计算出来的Cq值的有效性。如此一来,可减少核酸检测判读出现伪阳或伪阴的情况。
附图说明
图1是根据本公开内容的部分实施例示出一种数据预筛装置的方框图。
图2A、图2B是根据本公开内容的部分实施例示出一种数据预筛方法的流程图。
图3是根据本公开内容的部分实施例示出一种典型扩增曲线、一阶导数曲线以及二阶导数曲线的示意图。
图4是根据本公开内容的部分实施例示出一种非典型扩增曲线、一阶导数曲线以及二阶导数曲线的示意图。
图5是根据本公开内容的部分实施例示出另一种非典型扩增曲线的示意图。
图6是根据本公开内容的部分实施例示出又另一种非典型扩增曲线的示意图。
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